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搜索关键字:基因组    ( 230个结果
BZOJ 3578 GTY的人类基因组计划2 set
题目大意:有一些人一开始都在一号房间。有一些指令使他们区别的房间。每次选定一段区间作试验,如果有的房间的组合已经做过试验,那么就不计入最后的试验点数,否则计入试验点数为试验的人数。问最后会获得多少试验点数。 思路:对于每一个人随即一个long long,一个集合所代表的数字就是这些long long的异或和。然后用set来暴力判重。 CODE: #include #...
分类:其他好文   时间:2015-01-13 15:56:26    阅读次数:230
北京大学人类疾病基因研究中心
北京大学人类疾病基因研究中心是北京大学与原北京医科大学合并后,为适应21世纪医学生物学发展,争创世界一流大学而建立的研究中心,隶属北京大学,是一个独立的科研型实体,实行中心主任负责制,重点从事人类疾病基因组学和功能基因组学研究。目录1科研队伍2研究课题3研究方向1科研队伍编辑北京大学人类疾病基因研究...
分类:其他好文   时间:2014-11-30 22:56:46    阅读次数:213
【分块】【哈希】bzoj3578 GTY的人类基因组计划2
每个房间用一个集合来维护,具体来说,就是给1-n的数每个数一个long long的hash值,往集合S里insert(i),就是S^=HASH[i];erase(i),也是S^=HASH[i]。用map/set维护某个集合是否已经做过实验。分块,对每个块维护一个maxv[i],代表当前该块内的答案值...
分类:其他好文   时间:2014-10-19 15:29:13    阅读次数:199
Python之SparCC模块安装
<Inferring Correlation Networks from Genomic Survey Data>是篇讲从基因组数据得到基因间相关性的文章.该方法主要思想是逐步消除主基因的影响.地址:http://www.ploscompbiol.org/article/info%3Adoi%2F10.1371...
分类:编程语言   时间:2014-10-14 18:47:59    阅读次数:1047
tRNAscan-SE
tRNAscan-SE是一款可以在基因组上扫描tRNA的序列,也就是说你给定一组基因序列(fasta数据格式),可以用这个软件去预测这个序列是不是tRNA.具体的实现原理,我不搞生物,所以也就不太明白。tRNAscan-SE是在linux下运行的。 tRNAscan-SE有两种使用方法。 1)tR....
分类:其他好文   时间:2014-10-12 12:12:27    阅读次数:1037
Why you should QC your reads AND your assembly?
鲤鱼基因组:http://www.ntv.cn/a/20140923/52953.shtml关于鲤鱼基因组的测定,数据质量控制遭到质疑。Why you should QC your reads AND your assembly?Graham Etheringtonhttp://grahamethe...
分类:其他好文   时间:2014-10-05 13:53:28    阅读次数:158
调整进程优先级
最近要跑菠萝整个基因组的ahrd, 要做大量的blast, 但是恰好有个同学在使用cpu, 我的任务是比较重要的,所以想让cpu优先跑我的进程。优先值(值越小级别越高) = 优先系数(不可更改) + nice值(可手动更改)nice值的范围是-20到19所以想调整成最高优先级的话,将nice值设为-...
分类:其他好文   时间:2014-10-03 20:15:55    阅读次数:172
igv
integrative genomics viewer下载:http://www.broadinstitute.org/igv/download 下载前要注册导入参考基因组:http://www.broadinstitute.org/software/igv/LoadGenomeGenomes, l...
分类:其他好文   时间:2014-09-27 00:56:08    阅读次数:980
CRISPR–Cas系统,基因组改造新技术
zz:http://blog.sciencenet.cn/blog-614672-689702.html有一种细菌编码的酶能够利用向导RNA(guide RNA)分子对特定的DNA片段进行定向切割,科学家们利用这种特点开发出了一种能够对基因组进行特异性定点改造的工具,对细胞乃至整个生物体进行基因组改...
分类:其他好文   时间:2014-09-04 14:40:59    阅读次数:509
DNA分子结构3D模型
生物信息资源更新越来越快,使用可视化的方法来分析DNA序列已成为生物信息学的一个研究热点,用图形表示DNA序列的方法也越来越成熟。2011年,著名杂志《Science》发表一篇引起轰动的文章:《Presenting the Human Genome:Now is 3D!》,这篇文章完全给我们描述了人类基因组测序未来的蓝图,可见3D技术在很多领域都是发展方向。 使用mono可以快速的创建DNA分子结构立体模型。...
分类:其他好文   时间:2014-08-21 17:20:54    阅读次数:272
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