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一、InnoDB支持事务，MyISAM不支持，这一点是非常之重要。事务是一种高级的处理方式，如在一些列增删改中只要哪个出错还可以回滚还原，而MyISAM就不可以了。
二、MyISAM适合查询以及插入为主的应用，InnoDB适合频繁修改以及设计到安全性就高的应用
三、InnoDB支持外键，MyISAM不支持
四、MyISAM是默认引擎，InnoDB需要指定
五、InnoDB不支持FULLTEXT类型的索引
六、InnoDB中不保存表的行数，如select count(*) from table时，InnoDB需要扫描一遍整个表来计算有多少行，但是MyISAM只要简单的读出保存好的行数即可。注意的是，当count(*)语句包含where条件时MyISAM也需要扫描整个表
七、对于自增长的字段，InnoDB中必须包含只有该字段的索引，但是在MyISAM表中可以和其他字段一起建立联合索引
八、清空整个表时，InnoDB是一行一行的删除，效率非常慢。MyISAM则会重建表
九、InnoDB支持行锁（某些情况下还是锁整表，如 update table set a=1 where user like ‘%lee%‘）
十、MyISAM还使用一种表格锁定的机制，来优化多个并发的读写操作，其代价是你需要经常运行OPTIMIZE TABLE命令，来恢复被更新机制所浪费的空间
一般来说：MyISAM适合：(1)做很多count 的计算；(2)插入不频繁，查询非常频繁；(3)没有事务。
InnoDB适合：(1)可靠性要求比较高，或者要求事务；(2)表更新和查询都相当的频繁，并且表锁定的机会比较大的情况。
通过以上十点区别，结合自己项目的特点，就基本可以确定所需要的引擎了！
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原文地址：http://my.oschina.net/mn1127/blog/498474
