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为服务器生成证书
“运行”控制台，进入%JAVA_HOME%/bin目录，使用如下命令进入目录：
cd “c:\Program Files\Java\jdk1.6.0_11\bin”
使用keytool为Tomcat生成证书，假定目标机器的域名是“localhost”，keystore文件存放在“D:\home\tomcat.keystore”，口令为“password”，使用如下命令生成：
keytool -genkey -v -alias tomcat -keyalg RSA -keystore D:\home\tomcat.keystore -validity 36500 (参数简要说明：“D:\home\tomcat.keystore”含义是将证书文件的保存路径，证书文件名称是tomcat.keystore ；“-validity 36500”含义是证书有效期，36500表示100年，默认值是90天 “tomcat”为自定义证书名称)。
在命令行填写必要参数：
A、 输入keystore密码：此处需要输入大于6个字符的字符串。
B、 “您的名字与姓氏是什么？”这是必填项，并且必须是TOMCAT部署主机的域名或者IP[如：gbcom.com 或者 10.1.25.251]（就是你将来要在浏览器中输入的访问地址），否则浏览器会弹出警告窗口，提示用户证书与所在域不匹配。在本地做开发测试时，应填入“localhost”。
C、 你的组织单位名称是什么？”、“您的组织名称是什么？”、“您所在城市或区域名称是什么？”、“您所在的州或者省份名称是什么？”、“该单位的两字母国家代码是什么？”可以按照需要填写也可以不填写直接回车，在系统询问“正确吗？”时，对照输入信息，如果符合要求则使用键盘输入字母“y”，否则输入“n”重新填写上面的信息。
D、 输入<tomcat>的主密码，这项较为重要，会在tomcat配置文件中使用，建议输入与keystore的密码一致，设置其它密码也可以，完成上述输入后，直接回车则在你在第二步中定义的位置找到生成的文件。
为客户端生成证书
为浏览器生成证书，以便让服务器来验证它。为了能将证书顺利导入至IE和Firefox，证书格式应该是PKCS12，因此，使用如下命令生成：
keytool -genkey -v -alias mykey -keyalg RSA -storetype PKCS12 -keystore D:\home\mykey.p12 （mykey为自定义）。
对应的证书库存放在“D:\home\mykey.p12”，客户端的CN可以是任意值。双击mykey.p12文件，即可将证书导入至浏览器（客户端）。
让服务器信任客户端证书
由于是双向SSL认证，服务器必须要信任客户端证书，因此，必须把客户端证书添加为服务器的信任认证。由于不能直接将PKCS12格式的证书库导入，必须先把客户端证书导出为一个单独的CER文件，使用如下命令：
keytool -export -alias mykey -keystore D:\home\mykey.p12 -storetype PKCS12 -storepass password -rfc -file D:\home\mykey.cer
(mykey为自定义与客户端定义的mykey要一致，password是你设置的密码)。通过以上命令，客户端证书就被我们导出到“D:\home\mykey.cer”文件了。
下一步，是将该文件导入到服务器的证书库，添加为一个信任证书使用命令如下：
keytool -import -v -file D:\home\mykey.cer -keystore D:\home\tomcat.keystore
通过list命令查看服务器的证书库，可以看到两个证书，一个是服务器证书，一个是受信任的客户端证书：
keytool -list -keystore D:\home\tomcat.keystore (tomcat为你设置服务器端的证书名)。
让客户端信任服务器证书
由于是双向SSL认证，客户端也要验证服务器证书，因此，必须把服务器证书添加到浏览的“受信任的根证书颁发机构”。由于不能直接将keystore格式的证书库导入，必须先把服务器证书导出为一个单独的CER文件，使用如下命令：
keytool -keystore D:\home\tomcat.keystore -export -alias tomcat -file D:\home\tomcat.cer (tomcat为你设置服务器端的证书名)。
通过以上命令，服务器证书就被我们导出到“D:\home\tomcat.cer”文件了。双击tomcat.cer文件，按照提示安装证书，将证书填入到“受信任的根证书颁发机构”。
配置Tomcat服务器
打开Tomcat根目录下的/conf/server.xml，找到Connector port="8443"配置段，修改为如下：
<Connector port="8443" protocol="org.apache.coyote.http11.Http11NioProtocol"
SSLEnabled="true" maxThreads="150" scheme="https"
secure="true" clientAuth="true" sslProtocol="TLS"
keystoreFile="D:\\home\\tomcat.keystore" keystorePass="123456"
truststoreFile="D:\\home\\tomcat.keystore" truststorePass="123456" />
（tomcat要与生成的服务端证书名一致）
属性说明：
clientAuth:设置是否双向验证，默认为false，设置为true代表双向验证
keystoreFile:服务器证书文件路径
keystorePass:服务器证书密码
truststoreFile:用来验证客户端证书的根证书，此例中就是服务器证书
truststorePass:根证书密码
测试
在浏览器中输入:https://localhost:8443/，会弹出选择客户端证书界面，点击“确定”，会进入tomcat主页，地址栏后会有“锁”图标，表示本次会话已经通过HTTPS双向验证，接下来的会话过程中所传输的信息都已经过SSL信息加密。
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原文地址：http://my.oschina.net/u/1859350/blog/525871
