JDK与Eclipse之类的集成开发工具的关系

JDK是Java Development Kit，也就是说Java开发所需的工具包。有了这个东西，一切Java开发理论上都不是问题了。当然，根据你下载的版本不同，可能擅长的领域不同。通常大家都是用JDK来开发JavaSE应用的。

具体做法上，JDK里包含了用来编译源代码的javac命令，和用来执行字节码的java命令。只要设好了所用操作系统的PATH和CLASSPATH两个环境变量，对你所写的文本格式的Java源代码进行操作，原则上就不会出现代码编写问题以外的错误。但因为javac和java命令都是命令行命令，执行以及结果查看都有些麻烦。更麻烦的是代码的动态调试（也就是一边跑一边看每一步都做了什么）。

Eclipse是集成开发环境，就是解决上面说的命令执行和操作麻烦的问题的。使用这个工具，如果你不做什么特别的特殊的事情的话，你可以不用操心javac和java命令怎么用，参数是什么，各种环境变量如何配置等。只需要按照教程学会工具的使用，就可以很容易地书写你的代码，然后进行编译、执行以及调试。
而且，代码书写时会有很多提示，不用去记各个Class那些庞杂的方法名等。

也正是因为方便，它会在一定程度上影响你对Java相关命令的学习以及对常用Class的掌握。毕竟重复是加强记忆的最佳途径。什么都提示了，都自动了，就很难记住了。
这就是为什么有人反对你一开始使用这工具。