标签:机器学习
这是自 xgboost, cxxnet, minerva 以来集合DMLC几乎所有开发者 (李沐和陈天奇等各路英雄豪杰) 力量的一个机器学习项目。MXNet名字源于”Mix and Maximize”。MXnet 的目标就是希望把 cxxnet 这样强调性能静态优化的 C++ 库和灵活的 NDArray 有机结合在一起。做包含cxxnet 的静态优化,却又可以像 minerva, theano, torch 那样进行灵活扩展的深度学习库。
与其他工具相比,MXnet 结合了符号语言和过程语言的编程模型,并试图最大化各自优势,利用统一的执行引擎进行自动多 GPU 并行调度优化。不同的编程模型有各自的优势,以往的深度学习库往往着重于灵活性,或者性能。MXNet 通过融合的方式把各种编程模型整合在一起,并且通过统一的轻量级运行引擎进行执行调度。使得用户可以直接复用稳定高效的神经网络模块,并且可以通过 Python 等高级语言进行快速扩展。
MXNet 由 dmlc/cxxnet, dmlc/minerva 和 Purine2 的作者发起,融合了Minerva 的动态执行,cxxnet 的静态优化和 Purine2 的符号计算等思想,直接支持基于Python 的 parameter server 接口,使得代码可以很快向分布式进行迁移。每个模块都进行清晰设计,使得每一部分本身都具有被直接利用的价值。C 接口和静态/动态 Library 使得对于新语言的扩展更加容易,目前支持C++和python 2/3 ,接下来相信会有更多语言支持,并方便其他工具增加深度学习功能。
在数据流调度的基础上引入了读写操作调度,并且使得调度和调度对象无关,用以直接有机支持动态计算和静态计算的统一多 GPU 多线程调度,使得上层实现更加简洁灵活。
MXNet 支持基于静态计算流图符号计算。计算流图不仅使设计复杂网络更加简单快捷,而且基于计算流图,MXNet 可以更加高效得利用内存。同时进一步优化了静态执行的规划,内存需求比原本已经省的 cxxnet 还要少。
相比 cxxnet 的全静态执行,minerva 的全动态执行。MXNet采用动态静态混合执行引擎,可以把 cxxnet 静态优化的效率带和 ndarray 动态运行的灵活性结合起来。把高效的 c++ 库更加灵活地和 Python 等高级语言结合在一起。
在 MShadow C++ 表达式模板的基础上,符号计算和 ndarray 使在 Python 等高级语言内编写优化算法,损失函数和其他深度学习组件并高效无缝支持 CPU/GPU 成为可能。用户无需关心底层实现,在符号和 NDArray 层面完成逻辑即可进行高效的模型训练和预测。
所有数据模型可以从 S3/HDFS/Azure 上直接加载训练。
大量使用 C++11 特性,使 MXNet 利用最少的代码实现尽可能最大的功能。用约 11k 行 C++ 代码 (加上注释 4k 行) 实现了以上核心功能。
MXNet 提供了非常详细的用户文档和设计文档以及样例。所有的代码都有详细的文档注释。并且会持续更新代码和系统设计细节,希望对于广大深度学习系统开发和爱好者有所帮助。
DMLC (Distributed (Deep) Machine Learning Community) 是国内最大的开源分布式机器学习项目2。DMLC 的相关代码直接托管在 GitHub中,并采用 Apache2.0 协议进行维护。
推荐已编译的方式安装 MXnet,安装的过程分为2步3:
从 C++ 源码编译共享库(libmxnet.so for linux,libmxnet.dylib for osx,libmxnet.dll for windows);
安装语言包;
目标是构建共享库文件。
最小构建需求:
最新的支持C++ 11的C++编译器,比如g++ >= 4.8,clang
一份BLAS库,比如libblas,atlas,openblas,或者 intel mkl
可选库:
CUDA Toolkit >= v7.0 以运行 nvidia GPUs (需要 GPU 支持 Compute Capability >= 2.0)
CUDNN 加速 GPU computation (only CUDNN 3 is supported)
opencv 进行图像的分段 (如果编译安装,需要cmake)
sudo apt-get update sudo apt-get install -y build-essential git libatlas-base-dev libopencv-dev
构建MXnet:
git clone --recursive https://github.com/dmlc/mxnet cd mxnet; make -j$(nproc)
brew update brew tap homebrew/science brew info opencv brew install opencv
git clone --recursive https://github.com/dmlc/mxnet cd mxnet; cp make/osx.mk ./config.mk; make -j$(sysctl -n hw.ncpu)
进入源码目录编译好的python子目录安装python语言包即可
cd ./python/ sudo python setup.py install
更详细的安装文档参见官网手册。
多维的数据结构,提供在 cpu 或者 gpu 上进行矩阵运算和张量计算,能够自动并行计算
NDArray 是 MXnet 中最底层的计算单元,与 numpy.ndarray 非常相似,但是也有 2 点不同的特性:
支持多设备
所有的操作可以在不同的设备上运行,包括 cpu 和 gpu。
>>> import mxnet as mx >>> a = mx.nd.empty((2, 3)) # 在cpu0上创建一个2X3的矩阵 >>> b = mx.nd.empty((2, 3), mx.gpu()) # 在gpu0上创建一个2X3的矩阵 >>> c = mx.nd.empty((2, 3), mx.gpu(2)) # 在gpu2上创建一个2X3的矩阵 >>> c.shape # 维度(2L, 3L) >>> c.context # 设备信息gpu(2) # 其他的初始化方式 >>> a = mx.nd.zeros((2, 3)) # 创建2X3的全0矩阵 >>> b = mx.nd.ones((2, 3)) # 创建2X3的全1矩阵 >>> b[:] = 2 # 所有元素赋值为2# 不同的设备之间进行数据拷贝 >>> a = mx.nd.ones((2, 3)) >>> b = mx.nd.zeros((2, 3), mx.gpu())>>> a.copyto(b) # 从cpu拷贝数据到gpu # NDArray转换为numpy.ndarray >>> a = mx.nd.ones((2, 3)) >>> b = a.asnumpy() >>> type(b) <type ‘numpy.ndarray‘> >>> print b[[ 1. 1. 1.] [ 1. 1. 1.]] # numpy.ndarray转换为NDArray >>> import numpy as np >>> a = mx.nd.empty((2, 3)) >>> a[:] = np.random.uniform(-0.1, 0.1, a.shape) >>> print a.asnumpy()[[-0.06821112 -0.03704893 0.06688045] [ 0.09947646 -0.07700162 0.07681718]] # NDArray基本运算 >>> a = mx.nd.ones((2, 3)) * 2 >>> b = mx.nd.ones((2, 3)) * 4 >>> print b.asnumpy()[[ 4. 4. 4.] [ 4. 4. 4.]] >>> c = a + b # 对应元素求和 >>> print c.asnumpy() [[ 6. 6. 6.] [ 6. 6. 6.]] >>> d = a * b # 对应元素求积 >>> print d.asnumpy() [[ 8. 8. 8.] [ 8. 8. 8.]] # 不同设备上的NDArray需要移动到一起才能计算 >>> a = mx.nd.ones((2, 3)) * 2 >>> b = mx.nd.ones((2, 3), mx.gpu()) * 3 >>> c = a.copyto(mx.gpu()) * b >>> print c.asnumpy() [[ 6. 6. 6.] [ 6. 6. 6.]] # 数据的导出与载入 # 1. 通过pickle导出与载入数据 >>> import mxnet as mx >>> import pickle as pkl >>> a = mx.nd.ones((2, 3)) * 2 >>> data = pkl.dumps(a) >>> b = pkl.loads(data) >>> print b.asnumpy() [[ 2. 2. 2.] [ 2. 2. 2.]] # 2. 直接保存为二进制文件 >>> a = mx.nd.ones((2,3))*2 >>> b = mx.nd.ones((2,3))*3 >>> mx.nd.save(‘mydata.bin‘, [a, b]) >>> c = mx.nd.load(‘mydata.bin‘) >>> print c[0].asnumpy() [[ 2. 2. 2.] [ 2. 2. 2.]] >>> print c[1].asnumpy()[[ 3. 3. 3.] [ 3. 3. 3.]] # 直接保存到分布式文件系统上(s3或hdfs) >>> mx.nd.save(‘s3://mybucket/mydata.bin‘, [a,b]) >>> mx.nd.save(‘hdfs///users/myname/mydata.bin‘, [a,b])
自动并行计算
不同的操作自动进行并行计算。
a = mx.nd.ones((2,3)) b = a c = a.copyto(mx.cpu()) a += 1 b *= 3 c *= 3
a += 1
可与c *= 3
并行计算,因为在不同的设备上,但是a += 1
和b *= 3
只能相继执行。
Symbol使得非常容易定义神经网络,并且能自动求导
以下的范例创建了一个 2 层的感知器网络:
>>> import mxnet as mx >>> net = mx.symbol.Variable(‘data‘) >>> net = mx.symbol.FullyConnected(data=net, name=‘fc1‘, num_hidden=128) >>> net = mx.symbol.Activation(data=net, name=‘relu1‘, act_type="relu") >>> net = mx.symbol.FullyConnected(data=net, name=‘fc2‘, num_hidden=64) >>> net = mx.symbol.SoftmaxOutput(data=net, name=‘out‘) >>> type(net) <class ‘mxnet.symbol.Symbol‘>
每一个 Symbol 可以绑定一个名字,Variable 通常用来定义输入,其他的 Symbol 有一个参数data
以一个Symbol 类型作为输入数据,另外还有其他的超参数num_hidden
(隐藏层的神经元数目),act_type
(激活函数的类型)。
Symbol 的作用可以被简单的看成是实现了一个函数,函数的参数名称自动生成,可以通过以下的方式查看:
>>> net.list_arguments() [‘data‘, ‘fc1_weight‘, ‘fc1_bias‘, ‘fc2_weight‘, ‘fc2_bias‘, ‘out_label‘]
我们也可以明确指定这些自动生成的参数的名字:
>>> net = mx.symbol.Variable(‘data‘) >>> w = mx.symbol.Variable(‘myweight‘) >>> net = mx.symbol.FullyConnected(data=net, weight=w, name=‘fc1‘, num_hidden=128) >>> net.list_arguments() [‘data‘, ‘myweight‘, ‘fc1_bias‘]
Symbol 可以组合之后,在传入全连接中:
>>> lhs = mx.symbol.Variable(‘data1‘) >>> rhs = mx.symbol.Variable(‘data2‘) >>> net = mx.symbol.FullyConnected(data=lhs + rhs, name=‘fc1‘, num_hidden=128) >>> net.list_arguments() [‘data1‘, ‘data2‘, ‘fc1_weight‘, ‘fc1_bias‘]
Symbol 也可以被随后的操作替换:
>>> net = mx.symbol.Variable(‘data‘) >>> net = mx.symbol.FullyConnected(data=net, name=‘fc1‘, num_hidden=128) >>> net2 = mx.symbol.Variable(‘data2‘) >>> net2 = mx.symbol.FullyConnected(data=net2, name=‘net2‘, num_hidden=128) >>> composed_net = net(data=net2, name=‘compose‘) >>> composed_net.list_arguments() [‘data2‘, ‘net2_weight‘, ‘net2_bias‘, ‘compose_fc1_weight‘, ‘compose_fc1_bias‘]
一旦定义好了 Symbol,只需要指定输入数据的维度,就可以推算出各级中间参数的维度:
>>> net = mx.symbol.Variable(‘data‘) >>> net = mx.symbol.FullyConnected(data=net, name=‘fc1‘, num_hidden=10) >>> arg_shape, out_shape, aux_shape = net.infer_shape(data=(100, 100)) >>> dict(zip(net.list_arguments(), arg_shape)) {‘data‘: (100, 100), ‘fc1_weight‘: (10, 100), ‘fc1_bias‘: (10,)} >>> out_shape [(100, 10)]
接下来通过绑定变量,就可以执行实际的运算了:
>>> # 定义计算图 >>> A = mx.symbol.Variable(‘A‘) >>> B = mx.symbol.Variable(‘B‘) >>> C = A * B >>> a = mx.nd.ones(3) * 4 >>> b = mx.nd.ones(3) * 2 >>> # 绑定变量到Symbol >>> c_exec = C.bind(ctx=mx.cpu(), args={‘A‘ : a, ‘B‘: b}) >>> # 进行前向计算 >>> c_exec.forward() >>> c_exec.outputs[0].asnumpy() [ 8. 8. 8.]
KVStore
KVStore 实现了在多个运算器之间,或者在多台计算机之间的数据同步
通过create
可以对 kvstore 进行简单的初始化:
>>> kv = mx.kv.create(‘local‘) # 创建一个本地的kvstore >>> shape = (2,3) >>> kv.init(3, mx.nd.ones(shape)*2) >>> a = mx.nd.zeros(shape) >>> kv.pull(3, out = a) >>> print a.asnumpy() [[ 2. 2. 2.] [ 2. 2. 2.]]
初始化后,可以通过相同的 key 进行数值更新:
>>> kv.push(3, mx.nd.ones(shape)*8) >>> kv.pull(3, out = a) # 取出值 >>> print a.asnumpy() [[ 8. 8. 8.] [ 8. 8. 8.]]
push
的数据可以在任何设备上,此外,可以在同一个 key 上传递多个值,KVStore 会对多个值求和,push
聚合后的值:
>>> gpus = [mx.gpu(i) for i in range(4)] >>> b = [mx.nd.ones(shape, gpu) for gpu in gpus] >>> kv.push(3, b) >>> kv.pull(3, out = a) >>> print a.asnumpy() [[ 4. 4. 4.] [ 4. 4. 4.]]
KVStore 对每次push
进来的值做的默认行为是ASSIGN
,这个行为可以被自定义的行为替换:
>>> def update(key, input, stored): >>> print "update on key: %d" % key >>> stored += input * 2 >>> kv._set_updater(update) >>> kv.pull(3, out=a) >>> print a.asnumpy() [[ 4. 4. 4.] [ 4. 4. 4.]] >>> kv.push(3, mx.nd.ones(shape)) update on key: 3 >>> kv.pull(3, out=a) >>> print a.asnumpy() [[ 6. 6. 6.] [ 6. 6. 6.]]
同push
类似,通过一次调用,我们也可以将值同时pull
到多个设备上:
>>> b = [mx.nd.ones(shape, gpu) for gpu in gpus] >>> kv.pull(3, out = b) >>> print b[1].asnumpy() [[ 6. 6. 6.] [ 6. 6. 6.]]
除了单个 key-value 的存储,KVStrore 还提供了批量的接口:
# 针对单个设备 >>> keys = [5, 7, 9] >>> kv.init(keys, [mx.nd.ones(shape)]*len(keys)) >>> kv.push(keys, [mx.nd.ones(shape)]*len(keys)) update on key: 5 update on key: 7 update on key: 9 >>> b = [mx.nd.zeros(shape)]*len(keys) >>> kv.pull(keys, out = b) >>> print b[1].asnumpy() [[ 3. 3. 3.] [ 3. 3. 3.]] # 针对多个设备 >>> b = [[mx.nd.ones(shape, gpu) for gpu in gpus]] * len(keys) >>> kv.push(keys, b) update on key: 5 update on key: 7 update on key: 9 >>> kv.pull(keys, out = b) >>> print b[1][1].asnumpy() [[ 11. 11. 11.] [ 11. 11. 11.]]
MXnet体验
以下借助 MXnet 实现了一个简单的单变量线性回归程序:
import mxnet as mx import numpy as np import matplotlib.pyplot as plt # 定义输入数据 X_data = np.linspace(-1, 1, 100) noise = np.random.normal(0, 0.5, 100) y_data = 5 * X_data + noise # Plot 输入数据 fig = plt.figure() ax = fig.add_subplot(1, 1, 1) ax.scatter(X_data, y_data) # 定义mxnet变量 X = mx.symbol.Variable(‘data‘) Y = mx.symbol.Variable(‘softmax_label‘) # 定义网络 Y_ = mx.symbol.FullyConnected(data=X, num_hidden=1, name=‘pre‘) loss = mx.symbol.LinearRegressionOutput(data=Y_, label=Y, name=‘loss‘) # 定义模型 model = mx.model.FeedForward( ctx=mx.cpu(), symbol=loss, num_epoch=100, learning_rate=0.001, numpy_batch_size=1 ) # 训练模型 model.fit(X=X_data, y=y_data) # 预测 prediction = model.predict(X_data) lines = ax.plot(X_data, prediction, ‘r-‘, lw=5) plt.show()
MXnet 是个深度学习的框架,支持从单机到多GPU、多集群的计算能力。MXnet 真正厉害之处在于可以结合命令式编程和符号式编程两种风格。此外,MXnet 安装相对简单,社区活跃,文档虽然还不完善,好在易读易懂,代码也相对丰富,还是很容易上手的。
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