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1.使用PuTTY安装目录里的puttygen.exe工具。先点“生成(Generate)”，然后随意移动鼠标直到进度条填满，即可生成密钥
公钥部分：把上边那一段文字全选->复制备用。（不要点击“保存公钥(Save Public Key)”，点那个保存的公钥没有用！）
私钥部分：点击“保存私钥(Save Private Key)”，保存一个.ppk文件。
注：别给密钥文件加密码——加了密码，每次使用.ppk文件时就都需要提供，就背离自动登录这个目的。
自动登录
将公钥和私钥分别告知linux和PuTTY，就可以实现自动认证。
公钥文件：放在linux的一个文件里。
请先用PuTTY，输用户名密码登录linux。使用命令 nano ~/.ssh/authorized_keys 编辑authorized_keys文件。——通常这个文件不存在，nano会打开一个空文件。
把刚才COPY下来的公钥粘到这个文件里去。（PuTTY中按右键是粘贴。）
私钥文件：提供给PuTTY。
每次PuTTY登录时，在“连接 -> SSH -> 认证”选项中，“认证私钥文件”选择刚才的.ppk文件就可以自动登录了。
（英文版：Connection -> SSH -> Auth, Private keyfile for authentication）
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原文地址：http://www.cnblogs.com/sos-blue/p/5801340.html
