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我最终的解决方式：
1、编译时带上(-d .，如：javac -d . DirList.java)，这样就会把package对应的目录结构一块生成。如果直接java xxx.java，生成的class文件不带package目录结构，这样就需要根据package手工创建目录，再把class文件拷贝到目录中。
2、运行时带上package， 如：java thinking.java.DirList
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