JavaSE程序可以打包成Jar包(J其实可以理解为Java了)，而JavaWeb程序可以打包成war包(w其实可以理解为Web了)。然后把war发布到Tomcat的webapps目录下，Tomcat会在启动时自动解压war包。
JAR（Java Archive，Java 归档文件）是与平台无关的文件格式，它允许将许多文件组合成一个压缩文件。为 J2EE 应用程序创建的 JAR 文件是 EAR 文件（企业 JAR 文件）。
JAR 文件格式以流行的 ZIP 文件格式为基础。与 ZIP 文件不同的是，JAR 文件不仅用于压缩和发布，而且还用于部署和封装库、组件和插件程序，并可被像编译器和 JVM 这样的工具直接使用。在 JAR 中包含特殊的文件，如 manifests 和部署描述符，用来指示工具如何处理特定的 JAR。
如果一个Web应用程序的目录和文件非常多，那么将这个Web应用程序部署到另一台机器上，就不是很方便了，我们可以将Web应用程序打包成Web 归档（WAR）文件，这个过程和把Java类文件打包成JAR文件的过程类似。利用WAR文件，可以把Servlet类文件和相关的资源集中在一起进行发布。在这个过程中，Web应用程序就不是按照目录层次结构来进行部署了，而是把WAR文件作为部署单元来使用。
一个WAR文件就是一个Web应用程序，建立WAR文件，就是把整个Web应用程序（不包括Web应用程序层次结构的根目录）压缩起来，指定一个.war扩展名。下面我们将第2章的Web应用程序打包成WAR文件，然后发布
要注意的是，虽然WAR文件和JAR文件的文件格式是一样的，并且都是使用jar命令来创建，但就其应用来说，WAR文件和JAR文件是有根本区别的。JAR文件的目的是把类和相关的资源封装到压缩的归档文件中，而对于WAR文件来说，一个WAR文件代表了一个Web应用程序，它可以包含 Servlet、HTML页面、Java类、图像文件，以及组成Web应用程序的其他资源，而不仅仅是类的归档文件。war包中的文件按照一定目录结构来组织。根据其根目录下包含有html和jsp文件，或者包含有这两种文件的目录，另外还有WEB-INF目录。通常在WEB-INF目录下含有一个web.xml文件和一个classes目录，web.xml是这个应用的配置文件，而classes目录下则包含编译好的servlet类和jsp，或者servlet所依赖的其他类（如JavaBean）。通常这些所依赖的类也可以打包成jar包放在WEB-INF下的lib目录下。
jar包：通常是开发时要引用的通用类，打成包便于存放管理。简单来说，jar包就是别人已经写好的一些类，然后对这些类进行打包。可以将这些jar包引入到你的项目中，可以直接使用这些jar包中的类和属性，这些jar包一般放在lib目录下。我们什么时候应该使用WAR文件呢？在开发阶段不适合使用WAR文件，因为在开发阶段，经常需要添加或删除Web应用程序的内容，更新 Servlet类文件，而每一次改动后，重新建立WAR文件将是一件浪费时间的事情。在产品发布阶段，使用WAR文件是比较合适的，因为在这个时候，几乎不需要再做什么改动了。
在开发阶段，我们通常将Servlet源文件放到Web应用程序目录的src子目录下，以便和Web资源文件区分。在建立WAR文件时，只需要将src目录从Web应用程序目录中移走，就可以打包了
如果想生成war文件：可以使用如下命令：jar -cvf web1.war *本文出自 “梦想照进现实” 博客，请务必保留此出处http://lookingdream.blog.51cto.com/5177800/1951192
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