MySQL的海豚标志的名字叫“sakila”，它是由MySQL AB的创始人从用户在“海豚命名”的竞赛中建议的大量的名字表中选出的。获胜的名字是由来自非洲斯威士兰的开源软件开发者Ambrose Twebaze提供。根据Ambrose所说，Sakila来自一种叫SiSwati的斯威士兰方言，也是在Ambrose的家乡乌干达附近的坦桑尼亚的Arusha的一个小镇的名字。
MySQL的历史最早可以追溯到1979年，有一个人叫MontyWidenius, 为一个叫TcX的小公司打工，并用BASIC设计了一个报表工具，可以在4M主频和16KB内在的计算机上运行。过了不久，又将此工具，使用C语言重写，移植到Unix平台，当时，它只是一个很底层的面向报表的存储引擎。这个工具叫做Unireg。
1985 年，瑞典的几位志同道合小伙子（以David Axmark 为首）成立了一家公司，这就是MySQLAB 的前身。这个公司最初并不是为了开发数据库产品，而是在实现他们想法的过程中，需要一个数据库。他们希望能够使用开源的产品。但在当时并没有一个合适的选择，没办法，那就自己开发吧。
在最初，他们只是自己设计了一个利用索引顺序存取数据的方法，也就是I SA M（Indexed Sequential Access Method）存储引擎核心算法的前身，利用ISAM 结合mSQL 来实现他们的应用需求。在早期，他们主要是为瑞典的一些大型零售商提供数据仓库服务。在系统使用过程中，随着数据量越来越大，系统复杂度越来越高，ISAM 和mSQL 的组合逐渐不堪重负。在分析性能瓶颈之后，他们发现问题出在mSQL 上面。不得已，他们抛弃了mSQL，重新开发了一套功能类似的数据存储引擎，这就是ISAM 存储引擎。大家可能已经注意到他们当时的主要客户是数据仓库，应该也容易理解为什么直至现在，MySQL 最擅长的是查询性能，而不是事务处理（需要借助第三方存储引擎）。
1990年，TcX的customer 中开始有人要求要为它的API提供SQL支持，当时，有人想到了直接使用商用数据库算了，但是Monty觉得商用数据库的速度难令人满意。于是，他直接借助于mSQL的代码，将它集成到自己的存储引擎中。但不巧的是，效果并不太好。于是,Monty雄心大起，决心自己重写一个SQL支持。
1996年，MySQL 1.0发布, 在小范围内使用。到了96年10月，MySQL 3.11.1发布了，没有2.x版本。最开始，只提供了Solaris下的二进制版本。一个月后，Linux版本出现了。此时的MySQL还非常简陋，除了在一个表上做一些Insert，Update，Delete和Select 操作职位，没有其他更多的功能。
紧接下来的两年里，MySQL依次移植到各个平台下。它发布时，采用的许可策略，有些与众不同：允许免费商用，但是不能将MySQL与自己的产品绑定在一起发布。如果想一起发布，就必须使用特殊许可，意味着要花银子。当然，商业支持也是需要花银子的。其它的，随用户怎么用都可以。这种特殊许可为MySQL带来了一些收入，从而为它的持续发展打下了良好的基础。
1999-2000年，有一家公司在瑞典成立了，叫MySQL AB。 雇了几个人,与Sleepycat合作，开发出了Berkeley DB引擎, 因为BDB支持事务处理，所以，MySQL从此开始支持事务处理了。
在2000 年的时候，MySQL 公布了自己的源代码，并采用GPL（GNU General PublicLicense）许可协议，正式进入开源世界。
2000年4月，MySQL对旧的存储引擎进行了整理，命名为MyISAM。
2001年，Heikiki Tuuri向MySQL提出建议，希望能集成他们的存储引擎InnoDB，这个引擎同样支持事务处理，还支持行级锁。所以在2001年发布的3.23 版本的时候，该版本已经支持大多数的基本的SQL 操作，而且还集成了MyISAM和InnoDB 存储引擎。MySQL与InnoDB的正式结合版本是4.0。
2004年10月，发布了经典的4.1版本。 2005年10月，有发布了里程碑的一个版本，MySQL5.0. 在5.0中加入了游标，存储过程，触发器，视图和事务的支持。在5.0 之后的版本里，MySQL明确地表现出迈向高性能数据库的发展步伐。
2008年1月16号 MySQL被Sun公司收购。
2009年04月20日Oracle收购Sun 公司，MySQL 转入Oracle 门下。
2010年04月22 发布MySQL 5.5, MySQLcluster 7.1.
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