标签:attach 特性 table 统计 readonly 条件 泊松分布 ack 因变量
广义线性模型扩展了线性模型的框架,它包含了非正态的因变量分析
广义线性模型拟合形式:
$$g(\mu_\lambda) = \beta_0 + \sum_{j=1}^m\beta_jX_j$$
$g(\mu_\lambda)为连接函数$. 假设响应变量服从指数分布族中某个分布(不仅仅是正态分布),极大扩展了标准线性模型,模型参数估计的推导依据是极大似然估计,而非最小二乘法.
可以放松Y为正态分布的假设,改为Y服从指数分布族中的一种分布即可
glm()函数:glm(formula,family=family(link=function), data = )
Logistic regression:响应变量为二值(0,1), 模型假设Y服从二项分布,线性模型拟合形式:
可用以下代码拟合Logistic回归:glm(Y~X1+X2+X3, family = binomial(link=‘logit‘,data=mydata)
#通过婚外情数据来预测婚外情情况 #每个参与者身上有9个变量:性别,年龄,婚龄,是否有小孩,宗教信仰程度, #学历,职业,婚姻自我评分 library(AER) data(Affairs,package = ‘AER‘) #查看描述性统计信息 summary(Affairs) #将affairs转化Wie二值因子ynaaffair Affairs$ynaffair[Affairs$affairs > 0] <-1 Affairs$ynaffair[Affairs$affairs == 0] <-0 Affairs$ynaaffair <- factor(Affairs$ynaffair,levels=c(0,1),labels=c("NO","Yes")) table(Affairs$ynaffair) #因子化之后的值可以作为Logistic回归的结果变量 fit.full <- glm(ynaffair~gender+age+yearsmarried+children+religiousness+education+occupation+rating,data=Affairs,family=binomial()) #描述模型 summary(fit.full) #由P值得出性别,孩子,学历,职业对方程的贡献不显著,去除这些变量重新拟合 fit.reduced <- glm(ynaffair~age+yearsmarried+religiousness+rating,data=Affairs,family=binomial()) summary(fit.reduced) #由结果可以看出这次个每个回归系数都很显著 #由于两个模型嵌套,可以使用anova()对他们进行比较 #卡方值p=0.21,表明四个预测变量的新模型与九个预测变量的模拟拟合程度一样好 anova(fit.reduced,fit.full,test=‘Chisq‘) #解释模型系数:对数优势 coef(fit.reduced) #指数优势 exp(coef(fit.reduced)) #评价预测变量对结果概率的影响 #婚姻评分对婚外情概率的影响 #创建虚拟数据集,年龄,婚龄,宗教信仰均为均值,婚姻评分为1-5 testdata <- data.frame(rating=c(1,2,3,4,5),age=mean(Affairs$age),yearsmarried=mean(Affairs$yearsmarried),religiousness=mean(Affairs$religiousness)) testdata$prob = predict(fit.reduced,newdata = testdata,type="response") testdata
Logistic 回归变种:
Poisson regression:响应变量为计数型, 模型假设Y服从泊松分布, 线性模型拟合形式:
许多分析标准线性模型lm()连用的函数在glm()中都有对应的形式:
#使用robust包中的癫痫数据Breslow,来讨论癫痫数据对癫痫发病率的影响 library(robust) data(breslow.dat,package = "robust") names(breslow.dat) #我们只关注,Trt治疗条件,Age:年龄,基础癫痫发病数Base, 响应变量为sumY随机化后八周内癫痫发病数 summary(breslow.dat[c(6,7,8,10)]) opar <- par(no.readonly = TRUE) par(mfrow=c(1,2)) attach(breslow.dat) #图中可以看到因变量的偏倚特性和可能的离群点 hist(sumY,breaks = 20,xlab = "Seizure count",main="Distribution of Seizures") boxplot(sumY~Trt,xlab="Treatment",main="Group Comarisons") par(opar) #拟合泊松回归 fit <- glm(sumY~Base+Age+Trt,data=breslow.dat,family=poisson()) summary(fit) #获取模型系数 coef(fit) exp(coef(fit))
泊松回归的的变种:
模型拟合和回归诊断:
1. 初始响应变量的预测值和残差的图形
2. 检验模型是否过度离势
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原文地址:http://www.cnblogs.com/vincentcheng/p/7955387.html