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Python是一门广泛用于生物信息学、数据分析和Web编程等领域的编程语言。Python代码简单优雅，容易看懂，已经成为生物学家的热门编程语言。Python的一个好处是你可以快速地编写程序，而无需在掌握大量编程知识后编写程序。Python提供不同的编程风格，包括命令式编程风格、面向对象编程风格、函数编程风格和逻辑编程风格等，由于这些超出了本专辑的范围，我不会详细介绍。你将在本专辑中学习Python流行编程风格——命令式编程风格。Python可以快速入门，但是想学习Python的所有内容肯定需要一段时间的，大多数人可以学习本专辑中介绍的基础知识后，然后根据需要学习其他进阶书籍。
1. 下载安装
要学习Python编程，首先就得把Python安装到你的电脑里，就像你可能在计算机上安装的其他应用程序一样（例如，QQ、微信等）。它可以（免费）使用，并运行在普通生物实验室（Unix和Linux，Macintosh，Windows，VMS等）中的所有操作系统上。计算机上的Python应用程序使用Python语言程序（例如，您将在本书中编写的程序），将其转换为计算机可以理解的指令，并运行（或“执行”）它。
1.1 Python安装
目前，Python由两个大版本，2.x版和3.x版，这两个版本是不兼容的。由于3.x版本越来越普及，但新的3.7、3.6版本变化太大，我们的专辑
将以3.5版本为基础。此外，python编写的程序是可以跨平台运行的，因此，我们将以Windows系统（Windows 7）作为开发平台。
1.1.1 安装Python
首先，根据Windows系统位数（64/32）从Python官网下载python3.5对应的64位/32位安装程序，然后，运行下载的exe安装包。特别要注意勾上Add Python 3.5 to PATH，然后点“Install Now”即可完成安装。
1.1.2 安装测试
安装成功后，按“Win + R”组合键，运行“cmd”命令打开dos窗口，在dos窗口中输入“python",“回车”后会立刻得到如下执行结果，安装成功。
出现如下所示，是因为Windows会根据一个Path的环境变量设定的路径去查找python.exe，如果没找到，就会报错。如果在安装时漏掉了勾选Add Python 3.5 to PATH，那就要手动把python.exe所在的路径添加到Path中。如果你不知道怎么修改环境变量，建议把Python安装程序重新运行一遍，务必记得勾上Add Python 3.5 to PATH。
1.2 运行Python程序
在Windows系统上，通常将文件扩展名.py与Python程序相关联。 这是作为Python安装过程的一部分完成的，该过程修改了注册表设置以包含此文件关联。 然后，您可以通过在MS-DOS命令窗口中键入this_program或键入python this_program.py来启动this_program.py。 Windows有一个PATH变量，指定系统在其中查找程序的文件夹，这由Python安装过程修改，以包含Python应用程序文件夹的路径，通常为c：\ Python。 如果您尝试运行未安装在PATH变量已知的文件夹中的Python程序，则可以键入程序的完整路径名，例如:
py c：\ windows \ desktop \ my_program.py
或
python c：\ windows \ desktop \ my_program.py
。
2. 编写Python程序
现在计算机安装了Python，我们需要选择并学习文本编辑器的基础知识。文本编辑器用于键入文档（如程序），并将这些文档的内容保存到文件中。因此，要编写Python程序，需要使用文本编辑器。那么问题来了：文本编辑器到底哪家强？这里推荐的文本编辑器由Sublime Text、NotePad++、Atom。
安装好文本编辑器后，输入以下代码：
print("ATAGTAGATAGTA")
注意print前面不要有任何空格。然后，选择一个目录，例如D:\bioinformatics，把文件保存为chapter02_01.py，就可以打开命令行窗口，把当前目录切换到chapter02_01.py
D:\bioinformatics>py chapter02_01.py
ATAGTAGATAGTA
3. Python帮助文档
如果按照前面所述安装了Python，那么文档将作为常规Python安装的一部分进行安装（如下图所示）。Python标准文档包含了标准模块的使用信息和示例代码，当你参与编程时，你将学习不仅是标准参考手册，还有以外的资源，如书籍，在线文档，工作程序，新闻组，档案，期刊和会议等。最好是找到一些经验丰富的Pythonl程序员寻求帮助和建议。
参考资料
Begining Python for Bioinformatics
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原文地址：https://www.cnblogs.com/yahengwang/p/9369937.html
