ubuntu之bash配置文件

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    .profile是login用户登录后读取的文件,会读取.bashrc文件,可不管.

    .bashrc是非login用户读取的文件,例如在命令行输入bash也会读取该文件,主要的个人设置可放在这里

    本人的.bashrc目前只增加了PS1设置和相应增加的环境变量设置:

# Set PS1 
export PS1="\[\e[33;1m\]\u@\h \[\e[35;1m\]\t \[\e[36;1m\]\w\[\e[0m\]\n\[\e[32;1m\]$ \[\e[0m\]"

# User specific environment and startup programs
export LD_LIBRARY_PATH=/usr/local/lib:/usr/lib:$LD_LIBRARY_PATH                           
export PATH=/usr/local/bin:/usr/bin:$PATH

export JAVA_HOME=/usr/lib/jvm/java
export JRE_HOME=${JAVA_HOME}/jre
export CLASSPATH=.:${JAVA_HOME}/lib:${JRE_HOME}/lib
export PATH=${JAVA_HOME}/bin:$PATH

export MANPATH=/usr/local/texlive/2014/texmf-dist/doc/man:$MANPATH
export INFOPATH=/usr/local/texlive/2014/texmf-dist/doc/info:$INFOPATH
export PATH=/usr/local/texlive/2014/bin/x86_64-linux:$PATH

     一些软件的命令等的简写全放在.bash_aliases中:

# config
alias reload=‘source ~/.bashrc‘
alias bashrc=‘vim ~/.bashrc && source ~/.bashrc‘
alias bashpr=‘vim ~/.bash_profile && source ~/.profile‘
alias bashal=‘vim ~/.bash_aliases && source ~/.bash_aliases‘

# login
alias 184=‘cds && ssh $USER@192.168.8.184‘
alias 242=‘cds && ssh $USER@192.168.8.242‘
alias 241=‘cds && ssh $USER@192.168.8.241‘
alias gg=‘exit‘                                                                                                                                                         

# workspace
alias ws=‘cd ~/workspace‘
alias bws=‘cd ~/backup/workspace‘
alias wstest=‘cd ~/workspace/test‘

# chdir
alias ..=‘cd ..‘
alias ...=‘cd ../..‘
alias ....=‘cd ../../..‘
alias cd..=‘cd ..‘
alias -- -=‘cd -‘
alias cds=‘echo "`pwd`" > ~/.cdsave‘
alias cdb=‘cd "`cat ~/.cdsave`"‘
mcd() { mkdir -pv $@ && cd $@; }
cd2() { tmp=$(dirname $1); [ -d $1 ] && tmp=$1; cd $tmp && ls -l; }

# task
alias q1=‘qsub -cwd -q st.q -P st_ms -l vf=1G‘
alias q4=‘qsub -cwd -q st.q -P st_ms -l vf=4G‘
alias q8=‘qsub -cwd -q st.q -P st_ms -l vf=8G‘
alias q16=‘qsub -cwd -q st.q -P st_ms -l vf=16G‘
alias qsm=‘qsub -cwd -q st_supermem.q -P st_supermem -l vf=64G‘
alias qs=‘qstat -u $USER‘
alias qh=‘qhost -u $USER‘
alias qt=‘top -u $USER‘
alias task=‘perl ~/bin/task/task.pl‘
alias qdelall=‘qdel -u $USER‘
alias qsuball=‘perl ~/bin/task/qsub_all.pl‘
alias qgc=‘qstat -g c‘
alias psg=‘ps aux|grep‘
alias pgrep=‘pgrep -u $USER‘

# soft
alias install=‘sudo apt-get install‘

# disk
alias df=‘df -h‘  
alias du=‘du -h‘  
alias dus=‘du -sh‘
alias dul=‘du -Lh‘
alias du0=‘du --max-depth=0‘  
alias du1=‘du --max-depth=1‘  

# file
alias dir=‘ls -l‘
alias vdir=‘vdir --color=auto‘
alias fn=‘ls -l |grep "^-"|wc -l‘
alias dn=‘ls -l |grep "^d"|wc -l‘
alias fnt=‘ls -lR|grep "^-"|wc -l‘
alias wc=‘wc -l‘
alias row=‘wc -l‘
alias col=‘awk -F "\t" "{print NF}"‘
alias le=‘less -SN‘
alias ls=‘ls --color=auto‘
alias l=‘ls -CF‘
alias la=‘ls -A‘
alias ll=‘ls -alF‘
alias lx=‘ls -lhBX‘  
alias lz=‘ls -lhrS‘
alias lt=‘ls -lhrt‘  
alias vd=‘vimdiff‘
alias vi=‘vim‘  
alias cp=‘cp -vr‘ 
alias mv=‘mv -v‘ 
alias rm=‘rm -rf‘
alias chmod=‘chmod -v --preserve-root‘
alias chown=‘chown -v --preserve-root‘  
alias grep=‘grep -rn --color=auto‘  
alias egrep=‘egrep -rn --color=auto‘  
alias fgrep=‘fgrep -rn --color=auto‘  
alias mkdir=‘mkdir -pv‘  
alias ln=‘ln -s‘
alias delcol1=‘awk "{\$1=\"\";print \$0}"‘
alias delrow1=‘sed "1d"‘  # add -i can replace the file
alias row1=‘sed -n "1,1p"‘
alias row2=‘sed -n "2,1p"‘
alias g2u=‘iconv -f gbk -t utf-8‘  
alias u2g=‘iconv -f utf-8 -t gbk‘  
alias fd=‘find -type d -name‘  
alias ff=‘find -type f -name‘  
alias chx=‘chmod +x‘
alias tf=‘tail -f‘
alias sv=‘sudo vim‘
alias number=‘ls | wc -l‘
mvtmp() { mv $1 /tmp/ }
cptmp() { cp -r $@ /tmp/ }
switch() { mv $1 ${1}.tmp && mv $2 $1 && mv ${1}.tmp $2 }
rmf() { find . -type f -name $1 -print0 | xargs -0 rm -f }
del() { mv $@ ~/.local/share/Trash/files }
vimmul() { vim -o$#   $* }
targz() { tar czvf ${1%%/}.tar.gz ${1%%/}/ }
fff() { find . -type f -name $1 | xargs grep $2 }
bd() { find . -type f -size +500000000c| awk ‘{print "ls -latF --time-style=long-iso "$0}‘ | sh}                                                                      
bd3() { find . -type f -ctime -3 -size +500000000c| awk ‘{print "ls -latF --time-style=long-iso "$0}‘ | sh }
alias decompress=‘sh ~/bin/file/decompress.sh‘
alias fix=‘sh ~/bin/file/fix.sh‘


# others
alias alert=‘notify-send --urgency=low -i "$([ $? = 0 ] && echo terminal || echo error)" "$(history|tail -n1|sed -e ‘\‘‘s/^\s*[0-9]\+\s*//;s/[;&|]\s*alert$//‘\‘‘)"‘
alias which=‘alias | which --tty-only --read-alias --show-dot --show-tilde‘
alias sys=‘lsb_release -a‘
calc() { echo $* | bc }

# web
alias lftp=‘lftp user:pwd@ftpip‘  
alias ping=‘ping -c 5‘  

# R
alias R=‘R --no-save --quiet‘
alias Rs=‘Rscript‘

# sql
alias mysql=‘mysql -u root‘ 

# eclipse
alias eclipse=‘/opt/eclipse/eclipse‘

    其中一些稍微负责的命令放在~/bin下:

    task目录下task.pl文件查看当前任务状态:

#!/usr/bin/perl -w
use strict;
my $name=`whoami`;
if($ARGV[0]){$name=$ARGV[0]}
chomp $name;
my %hash=();
#print "$name";

my @task=`qstat -u $name`;
chomp @task;
my ($taskid,$taskname,$taskstate);
#my $msg=();
#my $open="no";
print "ID\tName         \tstate\tapply\tuse\tmax\n--------------------------------------------------------\n";

foreach my $task(@task){
    if($task=~/ja-task-ID/){next;}
    if($task=~/----------/){next;}
    $task=~s/^\s+//;
    ($taskid,$taskname,$taskstate)=(split /\s+/,$task)[0,2,4];
    my @mem=`qstat -j $taskid`;
    my $needmem=0;
    my $usemem=0;
    my $maxmem=0;
    foreach my $mem(@mem){
        if($mem=~/virtual_free=(\w+.?\w*)$/){$needmem=$1}
        if($mem=~/vmem=(\w+.\w+)/){$usemem=$1}
        if($mem=~/maxvmem=(\w+.\w+)/){$maxmem=$1}
    }
    print "$taskid\t$taskname      \t$taskstate\t$needmem\t$usemem\t$maxmem\n";
}

    task目录下qsub_all.pl文件详见:

http://my.oschina.net/u/1791586/blog/287156

    file目录下fix.sh:

# function: fix files or dirs permissions
if [ -d $1 ]; then
  find $1 -type d -exec chmod 755 {} \;
  find $1 -type f -exec chmod 644 {} \;
else
  echo "$1 is not a directory."
fi

file目录下decompress.sh:

# function: decompress file
if [ -f $1 ]; then
   case $1 in
     *.rar)          unrar x $1        ;;  # rar a    filename.rar dirname
     *.zip)          unzip $1          ;;  # zip -r   filename.zip dirname
     *.7z)           7z x $1           ;;  # 7z -t7z  dirname
     *.tar)          tar xvf $1        ;;  # tar cvf  filename.tar dirname
     *.tar.bz2)      tar xjvf $1       ;;  # tar cjvf filename.tar.bz2 dirname
     *.tbz2)         tar xjvf $1       ;;  # tar cjvf filename.tbz2 dirname
     *.bz2)          bunzip2 $1        ;;  # bzip2 -z  filename
     *.tgz)          tar xzvf $1       ;;  # tar czvf filename.tgz dirname
     *.tar.gz)       tar xzvf $1       ;;  # tar czvf filename.tar.gz dirname
     *.gz)           gunzip $1         ;;  # gzip     filename
     *.tar.Z)        tar xZvf $1       ;;  # tar cZvf filename.tar.Z dirname
     *.Z)            uncompress $1     ;;  # compress filename
     *.tar.xz)       tar xJvf $1       ;;  # tar cJvf filename.tar.xz dirname
     *.xz)           xz -d $1          ;;  # xz       filename
     *)              echo "‘$1‘ cannot be extracted via decompress()" ;;
   esac
else
   echo "‘$1‘ is not a valid file"
fi

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