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python学习——读取染色体长度(四:获取最长染色体的编号)

时间:2019-04-28 15:23:28      阅读:140      评论:0      收藏:0      [点我收藏+]

标签:长度   ota   python   解析   读取   ==   fast   for   编号   

# 读取fasta

# 解析每条序列的长度
chr_len = {‘chr1‘:10,‘chr2‘:20,‘chr3‘:30,‘chr4‘:40,‘chr5‘:15}

# 求和
total_len = sum(chr_len.values())

# 求最长染色体编号
max_chr =‘‘
max_len = 0
for [chr,len] in chr_len.items():
if len > max_len:
print(‘current chr > max chr‘)
max_chr = chr
max_len = len
elif len == max_len:
print(‘current chr == max chr‘)
else:
print(‘current chr < max chr‘)

# 输出结果
print(total_len)
print(max_len)
print(max_chr)

python学习——读取染色体长度(四:获取最长染色体的编号)

标签:长度   ota   python   解析   读取   ==   fast   for   编号   

原文地址:https://www.cnblogs.com/caicai2019/p/10784047.html

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