问题：
用网上找的开启慢查询日志的方法：
在/etc/my.cnf中添加
long_query_time=1 slow_query_log log_queries_not_using_indexes=1
然后再重启mysql。
慢查询日志确实开起来了，用select sleep(0.5),select sleep(1)来测试long_query_time的设置是生效的。但是在实际使用中在慢查询日志文件中出现了很多查询时间在小于1s的记录。
原因：
一、在mysql5.6英文手册的“5.2.5 The Slow Query Log”中说慢查询记录的条件：
The query must either not be an administrative statement, or log_slow_admin_statements
must be enabled.
The query must have taken at least long_query_time seconds, or log_queries_not_using_indexes
must be enabled and the query used no indexes for row lookups.
The query must have examined at least min_examined_row_limit rows.
The query must not be suppressed according to the log_throttle_queries_not_using_indexes
setting.
粗略地翻译下：
查询必询不是管理语句，或者开启了log_slow_admin_statements。
查询的时间至少是long_query_time的秒数,或者查询没有使用索引并且开启了log_queries_not_using_indexes。
查询至少检索了min_examined_row_limit 的行数.
查询必要不会根据log_throttle_queries_not_using_indexes
的设置而被抑制。
二、在mysql5.5 中文参考手册可以找到log-queries-not-using-indexes的说明：
如果你结合--log-slow-queries使用该选项，未使用索引的查询也被记录到慢查询日志中。
通过上面的资料就可以知道，因为开启了log_queries_not_using_indexes造成后，未使用索引的查询是否被记录和slow_query_time的设置无关
解决办法一：
修改/etc/my.cnf
log_queries_not_using_indexes=0
然后重启服务器。
解决办法二：
在mysql 查询中执行
set global log_queries_not_using_indexes=0;
参考：
mysql5.5中文参考手册
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mysql 5.6 设置long_query_time的值无效的原因
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