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Uniprot Python API

时间:2014-11-27 21:45:35      阅读:258      评论:0      收藏:0      [点我收藏+]

标签:http   io   使用   sp   on   bs   代码   as   tt   

简要回忆下,第一次使用是在大四,傻傻的用,老师教了一个定制所显示的列,就觉得神奇的不得了。

uniprot 提供了可供编程的api,这样大大简化了处理流程。http://www.uniprot.org/help/programmatic_access

不过,在进行batch retrieve时,没有提供python的代码,还是很蛋疼的。

于是又找到了一个module,https://pypi.python.org/pypi/uniprot_tools/0.4.1。用了这个之后还是非常方便的。

处理出的结果,用biopython中的swissprot模块进行解析。就ok了。Uniprot的服务挂掉了。明天再贴代码。

 

 

 

 

 

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今天买了六本书,《风流去》《三十六大》《自私的基因》《乖,摸摸头》《最好金龟换酒》《金融的解释》

媳妇看了之后很高兴。

继续看美国种族简史。

Uniprot Python API

标签:http   io   使用   sp   on   bs   代码   as   tt   

原文地址:http://www.cnblogs.com/hluo/p/4126726.html

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