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FP-Tree频繁模式树算法

时间:2015-01-29 09:40:29      阅读:534      评论:0      收藏:0      [点我收藏+]

标签:算法   机器学习   数据挖掘   数据   

参考资料http://blog.csdn.net/sealyao/article/details/6460578
更多数据挖掘算法https://github.com/linyiqun/DataMiningAlgorithm

介绍

FP-Tree算法全称是FrequentPattern Tree算法,就是频繁模式树算法,他与Apriori算法一样也是用来挖掘频繁项集的,不过不同的是,FP-Tree算法是Apriori算法的优化处理,他解决了Apriori算法在过程中会产生大量的候选集的问题,而FP-Tree算法则是发现频繁模式而不产生候选集。但是频繁模式挖掘出来后,产生关联规则的步骤还是和Apriori是一样的。

算法原理

FP树,FP树,那他当然是最终被构造成一个树的形状了。所以步骤如下:

1、创建根节点,用NULL标记。

2、统计所有的事务数据,统计事务中各个类型项的总支持度(在下面的例子中就是各个商品ID的总个数)

3、依次读取每条事务,比如T1, 1, 2, 5,因为按照总支持度计数数量降序排列,输入的数据顺序就是2, 1, 5,然后挂到根节点上。

4、依次读取后面的事务,并以同样的方式加入的FP树中,顺着根节点路径添加,并更新节点上的支持度计数。

最后就会形成这样的一棵树:

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然后还要新建一个项头表,代表所有节点的类型和支持度计数。这个东西在后面会有大用处。如果你以为FP树的算法过程到这里就结束了,你就大错特错了,算法的终结过程为最后的FP树只包括但路径,就是树呈现直线形式,也就是节点都只有1个孩子或没有孩子,顺着一条线下来,没有其他的分支。这就算是一条挖掘出的频繁模式。所以上面的算法还要继续递归的构造FP树,递归构造FP树的过程:

1、这时我们从最下面的I5开始取出。把I5加入到后缀模式中。后缀模式到时会于频繁模式组合出现构成最终的频繁模式。

2、获取频繁模式基,<I2, Ii>,<I2, I1, I3>,计数为I5节点的count值,然后以这2条件模式基为输入的事务,继续构造一个新的FP树

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3、这就是我们要达到的FP树单路径的目标了,不过这里个要求,要把支持度计数不够的点排除,这里的I3:1就不符号,所以最后I5后缀模式下的<I2, I1>与I5的组合模式了,就为<I2, I5>, <I1, I5>,<I1, I2, I5>。

I5下的挖掘频繁模式是比较简单的,没有出现递归,看一下I3下的递归构造,这就不简单了,同样的操作,最后就会出现下面这幅图的样子:

      技术分享         

发现还不是单条路径,继续递归构造,此时的后缀模式硬卧I3+I1,就是<I3, I1>,然后就来到了下面这幅图的情形了。

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后面的例子会有更详细的说明。

算法的实现

输入数据如下:

交易ID

商品ID列表

T100

I1I2I5

T200

I2I4

T300

I2I3

T400

I1I2I4

T500

I1I3

T600

I2I3

T700

I1I3

T800

I1I2I3I5

T900

I1I2I3

在文件中的形式就是:

T1 1 2 5  
T2 2 4  
T3 2 3  
T4 1 2 4  
T5 1 3  
T6 2 3  
T7 1 3  
T8 1 2 3 5  
T9 1 2 3 
算法的树节点类:

/**
 * FP树节点
 * 
 * @author lyq
 * 
 */
public class TreeNode implements Comparable<TreeNode>, Cloneable{
	// 节点类别名称
	private String name;
	// 计数数量
	private Integer count;
	// 父亲节点
	private TreeNode parentNode;
	// 孩子节点,可以为多个
	private ArrayList<TreeNode> childNodes;
	
	public TreeNode(String name, int count){
		this.name = name;
		this.count = count;
	}

	public String getName() {
		return name;
	}

	public void setName(String name) {
		this.name = name;
	}

	public Integer getCount() {
		return count;
	}

	public void setCount(Integer count) {
		this.count = count;
	}

	public TreeNode getParentNode() {
		return parentNode;
	}

	public void setParentNode(TreeNode parentNode) {
		this.parentNode = parentNode;
	}

	public ArrayList<TreeNode> getChildNodes() {
		return childNodes;
	}

	public void setChildNodes(ArrayList<TreeNode> childNodes) {
		this.childNodes = childNodes;
	}

	@Override
	public int compareTo(TreeNode o) {
		// TODO Auto-generated method stub
		return o.getCount().compareTo(this.getCount());
	}

	@Override
	protected Object clone() throws CloneNotSupportedException {
		// TODO Auto-generated method stub
		//因为对象内部有引用,需要采用深拷贝
		TreeNode node = (TreeNode)super.clone(); 
		if(this.getParentNode() != null){
			node.setParentNode((TreeNode) this.getParentNode().clone());
		}
		
		if(this.getChildNodes() != null){
			node.setChildNodes((ArrayList<TreeNode>) this.getChildNodes().clone());
		}
		
		return node;
	}
	
}
算法主要实现类:

package DataMining_FPTree;

import java.io.BufferedReader;
import java.io.File;
import java.io.FileReader;
import java.io.IOException;
import java.util.ArrayList;
import java.util.Collections;
import java.util.HashMap;
import java.util.Map;

/**
 * FPTree算法工具类
 * 
 * @author lyq
 * 
 */
public class FPTreeTool {
	// 输入数据文件位置
	private String filePath;
	// 最小支持度阈值
	private int minSupportCount;
	// 所有事物ID记录
	private ArrayList<String[]> totalGoodsID;
	// 各个ID的统计数目映射表项,计数用于排序使用
	private HashMap<String, Integer> itemCountMap;

	public FPTreeTool(String filePath, int minSupportCount) {
		this.filePath = filePath;
		this.minSupportCount = minSupportCount;
		readDataFile();
	}

	/**
	 * 从文件中读取数据
	 */
	private void readDataFile() {
		File file = new File(filePath);
		ArrayList<String[]> dataArray = new ArrayList<String[]>();

		try {
			BufferedReader in = new BufferedReader(new FileReader(file));
			String str;
			String[] tempArray;
			while ((str = in.readLine()) != null) {
				tempArray = str.split(" ");
				dataArray.add(tempArray);
			}
			in.close();
		} catch (IOException e) {
			e.getStackTrace();
		}

		String[] temp;
		int count = 0;
		itemCountMap = new HashMap<>();
		totalGoodsID = new ArrayList<>();
		for (String[] a : dataArray) {
			temp = new String[a.length - 1];
			System.arraycopy(a, 1, temp, 0, a.length - 1);
			totalGoodsID.add(temp);
			for (String s : temp) {
				if (!itemCountMap.containsKey(s)) {
					count = 1;
				} else {
					count = ((int) itemCountMap.get(s));
					// 支持度计数加1
					count++;
				}
				// 更新表项
				itemCountMap.put(s, count);
			}
		}
	}

	/**
	 * 根据事物记录构造FP树
	 */
	private void buildFPTree(ArrayList<String> suffixPattern,
			ArrayList<ArrayList<TreeNode>> transctionList) {
		// 设置一个空根节点
		TreeNode rootNode = new TreeNode(null, 0);
		int count = 0;
		// 节点是否存在
		boolean isExist = false;
		ArrayList<TreeNode> childNodes;
		ArrayList<TreeNode> pathList;
		// 相同类型节点链表,用于构造的新的FP树
		HashMap<String, ArrayList<TreeNode>> linkedNode = new HashMap<>();
		HashMap<String, Integer> countNode = new HashMap<>();
		// 根据事物记录,一步步构建FP树
		for (ArrayList<TreeNode> array : transctionList) {
			TreeNode searchedNode;
			pathList = new ArrayList<>();
			for (TreeNode node : array) {
				pathList.add(node);
				nodeCounted(node, countNode);
				searchedNode = searchNode(rootNode, pathList);
				childNodes = searchedNode.getChildNodes();

				if (childNodes == null) {
					childNodes = new ArrayList<>();
					childNodes.add(node);
					searchedNode.setChildNodes(childNodes);
					node.setParentNode(searchedNode);
					nodeAddToLinkedList(node, linkedNode);
				} else {
					isExist = false;
					for (TreeNode node2 : childNodes) {
						// 如果找到名称相同,则更新支持度计数
						if (node.getName().equals(node2.getName())) {
							count = node2.getCount() + node.getCount();
							node2.setCount(count);
							// 标识已找到节点位置
							isExist = true;
							break;
						}
					}

					if (!isExist) {
						// 如果没有找到,需添加子节点
						childNodes.add(node);
						node.setParentNode(searchedNode);
						nodeAddToLinkedList(node, linkedNode);
					}
				}

			}
		}

		// 如果FP树已经是单条路径,则输出此时的频繁模式
		if (isSinglePath(rootNode)) {
			printFrequentPattern(suffixPattern, rootNode);
			System.out.println("-------");
		} else {
			ArrayList<ArrayList<TreeNode>> tList;
			ArrayList<String> sPattern;
			if (suffixPattern == null) {
				sPattern = new ArrayList<>();
			} else {
				// 进行一个拷贝,避免互相引用的影响
				sPattern = (ArrayList<String>) suffixPattern.clone();
			}

			// 利用节点链表构造新的事务
			for (Map.Entry entry : countNode.entrySet()) {
				// 添加到后缀模式中
				sPattern.add((String) entry.getKey());
				//获取到了条件模式机,作为新的事务
				tList = getTransactionList((String) entry.getKey(), linkedNode);
				
				System.out.print("[后缀模式]:{");
				for(String s: sPattern){
					System.out.print(s + ", ");
				}
				System.out.print("}, 此时的条件模式基:");
				for(ArrayList<TreeNode> tnList: tList){
					System.out.print("{");
					for(TreeNode n: tnList){
						System.out.print(n.getName() + ", ");
					}
					System.out.print("}, ");
				}
				System.out.println();
				// 递归构造FP树
				buildFPTree(sPattern, tList);
				// 再次移除此项,构造不同的后缀模式,防止对后面造成干扰
				sPattern.remove((String) entry.getKey());
			}
		}
	}

	/**
	 * 将节点加入到同类型节点的链表中
	 * 
	 * @param node
	 *            待加入节点
	 * @param linkedList
	 *            链表图
	 */
	private void nodeAddToLinkedList(TreeNode node,
			HashMap<String, ArrayList<TreeNode>> linkedList) {
		String name = node.getName();
		ArrayList<TreeNode> list;

		if (linkedList.containsKey(name)) {
			list = linkedList.get(name);
			// 将node添加到此队列中
			list.add(node);
		} else {
			list = new ArrayList<>();
			list.add(node);
			linkedList.put(name, list);
		}
	}

	/**
	 * 根据链表构造出新的事务
	 * 
	 * @param name
	 *            节点名称
	 * @param linkedList
	 *            链表
	 * @return
	 */
	private ArrayList<ArrayList<TreeNode>> getTransactionList(String name,
			HashMap<String, ArrayList<TreeNode>> linkedList) {
		ArrayList<ArrayList<TreeNode>> tList = new ArrayList<>();
		ArrayList<TreeNode> targetNode = linkedList.get(name);
		ArrayList<TreeNode> singleTansaction;
		TreeNode temp;

		for (TreeNode node : targetNode) {
			singleTansaction = new ArrayList<>();

			temp = node;
			while (temp.getParentNode().getName() != null) {
				temp = temp.getParentNode();
				singleTansaction.add(new TreeNode(temp.getName(), 1));
			}

			// 按照支持度计数得反转一下
			Collections.reverse(singleTansaction);

			for (TreeNode node2 : singleTansaction) {
				// 支持度计数调成与模式后缀一样
				node2.setCount(node.getCount());
			}

			if (singleTansaction.size() > 0) {
				tList.add(singleTansaction);
			}
		}

		return tList;
	}

	/**
	 * 节点计数
	 * 
	 * @param node
	 *            待加入节点
	 * @param nodeCount
	 *            计数映射图
	 */
	private void nodeCounted(TreeNode node, HashMap<String, Integer> nodeCount) {
		int count = 0;
		String name = node.getName();

		if (nodeCount.containsKey(name)) {
			count = nodeCount.get(name);
			count++;
		} else {
			count = 1;
		}

		nodeCount.put(name, count);
	}

	/**
	 * 显示决策树
	 * 
	 * @param node
	 *            待显示的节点
	 * @param blankNum
	 *            行空格符,用于显示树型结构
	 */
	private void showFPTree(TreeNode node, int blankNum) {
		System.out.println();
		for (int i = 0; i < blankNum; i++) {
			System.out.print("\t");
		}
		System.out.print("--");
		System.out.print("--");

		if (node.getChildNodes() == null) {
			System.out.print("[");
			System.out.print("I" + node.getName() + ":" + node.getCount());
			System.out.print("]");
		} else {
			// 递归显示子节点
			// System.out.print("【" + node.getName() + "】");
			for (TreeNode childNode : node.getChildNodes()) {
				showFPTree(childNode, 2 * blankNum);
			}
		}

	}

	/**
	 * 待插入节点的抵达位置节点,从根节点开始向下寻找待插入节点的位置
	 * 
	 * @param root
	 * @param list
	 * @return
	 */
	private TreeNode searchNode(TreeNode node, ArrayList<TreeNode> list) {
		ArrayList<TreeNode> pathList = new ArrayList<>();
		TreeNode tempNode = null;
		TreeNode firstNode = list.get(0);
		boolean isExist = false;
		// 重新转一遍,避免出现同一引用
		for (TreeNode node2 : list) {
			pathList.add(node2);
		}

		// 如果没有孩子节点,则直接返回,在此节点下添加子节点
		if (node.getChildNodes() == null) {
			return node;
		}

		for (TreeNode n : node.getChildNodes()) {
			if (n.getName().equals(firstNode.getName()) && list.size() == 1) {
				tempNode = node;
				isExist = true;
				break;
			} else if (n.getName().equals(firstNode.getName())) {
				// 还没有找到最后的位置,继续找
				pathList.remove(firstNode);
				tempNode = searchNode(n, pathList);
				return tempNode;
			}
		}

		// 如果没有找到,则新添加到孩子节点中
		if (!isExist) {
			tempNode = node;
		}

		return tempNode;
	}

	/**
	 * 判断目前构造的FP树是否是单条路径的
	 * 
	 * @param rootNode
	 *            当前FP树的根节点
	 * @return
	 */
	private boolean isSinglePath(TreeNode rootNode) {
		// 默认是单条路径
		boolean isSinglePath = true;
		ArrayList<TreeNode> childList;
		TreeNode node;
		node = rootNode;

		while (node.getChildNodes() != null) {
			childList = node.getChildNodes();
			if (childList.size() == 1) {
				node = childList.get(0);
			} else {
				isSinglePath = false;
				break;
			}
		}

		return isSinglePath;
	}

	/**
	 * 开始构建FP树
	 */
	public void startBuildingTree() {
		ArrayList<TreeNode> singleTransaction;
		ArrayList<ArrayList<TreeNode>> transactionList = new ArrayList<>();
		TreeNode tempNode;
		int count = 0;

		for (String[] idArray : totalGoodsID) {
			singleTransaction = new ArrayList<>();
			for (String id : idArray) {
				count = itemCountMap.get(id);
				tempNode = new TreeNode(id, count);
				singleTransaction.add(tempNode);
			}

			// 根据支持度数的多少进行排序
			Collections.sort(singleTransaction);
			for (TreeNode node : singleTransaction) {
				// 支持度计数重新归为1
				node.setCount(1);
			}
			transactionList.add(singleTransaction);
		}

		buildFPTree(null, transactionList);
	}

	/**
	 * 输出此单条路径下的频繁模式
	 * 
	 * @param suffixPattern
	 *            后缀模式
	 * @param rootNode
	 *            单条路径FP树根节点
	 */
	private void printFrequentPattern(ArrayList<String> suffixPattern,
			TreeNode rootNode) {
		ArrayList<String> idArray = new ArrayList<>();
		TreeNode temp;
		temp = rootNode;
		// 用于输出组合模式
		int length = 0;
		int num = 0;
		int[] binaryArray;

		while (temp.getChildNodes() != null) {
			temp = temp.getChildNodes().get(0);

			// 筛选支持度系数大于最小阈值的值
			if (temp.getCount() >= minSupportCount) {
				idArray.add(temp.getName());
			}
		}

		length = idArray.size();
		num = (int) Math.pow(2, length);
		for (int i = 0; i < num; i++) {
			binaryArray = new int[length];
			numToBinaryArray(binaryArray, i);

			// 如果后缀模式只有1个,不能输出自身
			if (suffixPattern.size() == 1 && i == 0) {
				continue;
			}

			System.out.print("频繁模式:{【后缀模式:");
			// 先输出固有的后缀模式
			if (suffixPattern.size() > 1
					|| (suffixPattern.size() == 1 && idArray.size() > 0)) {
				for (String s : suffixPattern) {
					System.out.print(s + ", ");
				}
			}
			System.out.print("】");
			// 输出路径上的组合模式
			for (int j = 0; j < length; j++) {
				if (binaryArray[j] == 1) {
					System.out.print(idArray.get(j) + ", ");
				}
			}
			System.out.println("}");
		}
	}

	/**
	 * 数字转为二进制形式
	 * 
	 * @param binaryArray
	 *            转化后的二进制数组形式
	 * @param num
	 *            待转化数字
	 */
	private void numToBinaryArray(int[] binaryArray, int num) {
		int index = 0;
		while (num != 0) {
			binaryArray[index] = num % 2;
			index++;
			num /= 2;
		}
	}

}
算法调用测试类:

/**
 * FPTree频繁模式树算法
 * @author lyq
 *
 */
public class Client {
	public static void main(String[] args){
		String filePath = "C:\\Users\\lyq\\Desktop\\icon\\testInput.txt";
		//最小支持度阈值
		int minSupportCount = 2;
		
		FPTreeTool tool = new FPTreeTool(filePath, minSupportCount);
		tool.startBuildingTree();
	}
}
输出的结果为:

[后缀模式]:{3, }, 此时的条件模式基:{2, }, {1, }, {2, 1, }, 
[后缀模式]:{3, 2, }, 此时的条件模式基:
频繁模式:{【后缀模式:3, 2, 】}
-------
[后缀模式]:{3, 1, }, 此时的条件模式基:{2, }, 
频繁模式:{【后缀模式:3, 1, 】}
频繁模式:{【后缀模式:3, 1, 】2, }
-------
[后缀模式]:{2, }, 此时的条件模式基:
-------
[后缀模式]:{1, }, 此时的条件模式基:{2, }, 
频繁模式:{【后缀模式:1, 】2, }
-------
[后缀模式]:{5, }, 此时的条件模式基:{2, 1, }, {2, 1, 3, }, 
频繁模式:{【后缀模式:5, 】2, }
频繁模式:{【后缀模式:5, 】1, }
频繁模式:{【后缀模式:5, 】2, 1, }
-------
[后缀模式]:{4, }, 此时的条件模式基:{2, }, {2, 1, }, 
频繁模式:{【后缀模式:4, 】2, }
-------
读者可以自己手动的构造一下,可以更深的理解这个过程,然后对照本人的代码做对比。

算法编码时的难点

1、在构造树的时候要重新构建一棵树的时候,要不能对原来的树做更改,在此期间用了老的树的对象,又造成了重复引用的问题了,于是果断又new了一个TreeNode,只把原树的name,和count值拿了过来,父子节点关系完全重新构造。

2、在事务生产树的过程中,把事务映射到TreeNode数组中,然后过程就是加Node节点或者更新Node节点的count值,过程简单许多,也许会让人很难理解,应该个人感觉这样比较方便,如果是死板的String[]字符串数组的形式,中间还要与TreeNode各种转化非常麻烦。

3、在计算条件模式基的时候,我是存在了HashMap<String, ArrayList<TreeNode>>map中,并并没有搞成链表的形式,直接在生成树的时候就全部统计好。

4、此处算法用了2处递归,一个地方是在添加树节点的时候,搜索要在哪个node上做添加的方法,searchNode(TreeNode node, ArrayList<TreeNode> list),还有一个是整个的buildFPTree()算法,都不是能够一眼就能看明白的地方。希望大家能够理解我的用意。

FP-Tree算法的缺点

尽管FP-Tree算法在挖掘频繁模式的过程中相较Apriori算法里没有产生候选集了,比Apriori也快了一个数量级上了,但是整体上FP-Tree算法的时间,空间消耗开销上还是挺大的。

交易ID

商品ID列表

T100

I1I2I5

T200

I2I4

T300

I2I3

T400

I1I2I4

T500

I1I3

T600

I2I3

T700

I1I3

T800

I1I2I3I5

T900

I1I2I3

FP-Tree频繁模式树算法

标签:算法   机器学习   数据挖掘   数据   

原文地址:http://blog.csdn.net/androidlushangderen/article/details/43234309

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