标签：
RMA算法分三步：
一、背景校正（没精力写了）
二、归一化（没精力写了）
三、计算表达值
假设有5张芯片，这些芯片的某个探针组包含5个探针，它们的表达值如下：
GeneChip
4 8 6 9 7
3 1 2 4 5
Probe 6 10 7 12 9
4 5 8 9 6
7 11 8 12 10
（1）获取每一行的中位数：
Rdelta
4 8 6 9 7 7
3 1 2 4 5 3
6 10 7 12 9 9
4 5 8 9 6 6
7 11 8 12 10 10
（2）每一行减去这个中位数：
-3 1 -1 2 0
0 -2 -1 1 2
-3 1 -2 3 0
-2 -1 2 3 0
-3 1 -2 2 0
（3）获取每一列的中位数：
-3 1 -1 2 0
0 -2 -1 1 2
-3 1 -2 3 0
-2 -1 2 3 0
-3 1 -2 2 0
Cdelta -3 1 -1 2 0
（4）每一列减去这个中位数：
0 0 0 0 0
3 -3 0 -1 2
0 0 -1 1 0
1 -2 3 1 0
0 0 -1 0 0
（5）这时，（4）中的每一行、每一列的中位数都是0。若不符合这个条件，则重复执行（1）~（4）的步骤，直到符合为止。
（6）原始矩阵：
4 8 6 9 7
3 1 2 4 5
6 10 7 12 9
4 5 8 9 6
7 11 8 12 10
减去（4）的矩阵：
0 0 0 0 0
3 -3 0 -1 2
0 0 -1 1 0
1 -2 3 1 0
0 0 -1 0 0
得到：
4 8 6 9 7
0 4 2 5 3
6 10 8 11 9
3 7 5 8 6
7 11 9 12 10
每一列求平均值：
4 8 6 9 7
——>这5个数是最终结果，代表5个样品的该探针组的表达值
标签：
原文地址：http://www.cnblogs.com/xianwen/p/4522575.html
