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搜索关键字:分子模拟    ( 7个结果
高性能计算在生命科学领域的运用与瓶颈
生命科学的研究范围十分广泛,通常包括生物学和药物学 ,以生物学来说,研究人员为了理解生物细胞中发生的各种生物化学过程,研究者需要详细地了解生物大分子,如蛋白质、核酸等,在多个时间和空间尺度下的结构、动力学和功能等,以及这些生物分子之间动态相互作用的具体细节。实验可以得到生物分子的静态结构,提供生物分 ...
分类:其他好文   时间:2021-05-24 00:52:15    阅读次数:0
分子动力学模拟——原理
分子模拟定义及方法 将一定数量的分子输入计算机内进行分子微观结构的测定和宏观性质的计算。按照获得微观态的方法不同,分子模拟可以分为: 1.Monte Carlo蒙特卡罗方法,MC:1.构型平均,不包含动力学部分;2.利用概率行走产生微观态。 2.Molecular Dynamics分子动力学,MD: ...
分类:其他好文   时间:2018-12-21 15:21:14    阅读次数:2167
Monte Carlo simulated annealing
蒙特·卡罗分子模拟计算 蒙特·卡罗分子模拟计算 使用蒙特·卡罗方法进行分子模拟计算是按照以下步骤进行的: 1. 使用随机数发生器产生一个随机的分子构型。 2. 对此分子构型的其中粒子坐标做无规则的改变,产生一个新的分子构型。 3. 计算新的分子构型的能量。 4. 比较新的分子构型于改变前的分子构型的 ...
分类:其他好文   时间:2018-08-07 21:58:12    阅读次数:172
在centos6.4上安装xmgrace
网上教程修正版①tarxvzfgrace-5.1.20.tar.gz//http://www.ftpstatus.com/file_properties.php?sname=plasma-gate.weizmann.ac.il&fid=15②cdgrace-5.1.20--prefix=/usr/local/grace③./configure④make⑤makeinstall⑥cd/usr/binln-s/usr/local/grace/bin/xmgracexmgrace//-f
分类:其他好文   时间:2017-01-05 18:47:38    阅读次数:187
分子模拟软件Schrodinger Suites 2015安装
安装平台:redhat 5.6schrodinger 2015先把schrodinger_2015.iso 挂载到/mnt>>>> mount -o loop schrodinger_2015.iso/mnt>>>> cd /mnt>>>> ./INSTALL安装之后进行破解:返回到/mnt 进入c...
分类:其他好文   时间:2015-10-13 10:27:09    阅读次数:3084
Chemical Computing Group MOE (Molecular Operating Environment) v2014.0901 2DVD分子模拟
Chemical Computing Group MOE (Molecular Operating Environment) v2014.0901 2DVD分子模拟MOE由Chemical Computing Group公司推出的Molecular Operating Environment(简称M...
分类:其他好文   时间:2015-08-11 15:56:19    阅读次数:659
分子模拟及药物设计软件 CCG MOE v2014.0901
分子模拟及药物设计软件 CCG MOE v2014.0901MOE:分子操作环境MOE - 结构化设计基于结构的设计活动现场检测蛋白质:配体相互作用图配体优化简化的界面联系方式统计,静电和互动地图溶剂分析与3D-RISM更换支架配体:受体对接多片段搜索自动化结构准备==============客服Q...
分类:其他好文   时间:2015-08-05 14:30:04    阅读次数:1075
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