glean工具 当用各类工具完成了注释后，一个问题是，每一个基因组区域，都会获得大量redundant的基因结构注释，到底哪一个注释才是最可靠的？所以，我们需要一个整合工具。 有一种工具是通过统计打分，先手工注释一些基因，然后把所有的自动注释结果跟手工注释比较，给各个工具打个分，最后用这个打分矩阵扩 ...
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2020-02-03 20:53:19
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ALS矩阵分解 http://blog.csdn.net/oucpowerman/article/details/49847979 http://www.open-open.com/lib/view/open1457672855046.html 一个的打分矩阵 A 可以用两个小矩阵和的乘积来近似,描 ...
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2018-01-20 16:28:11
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一、矩阵分解回想 在博文推荐算法——基于矩阵分解的推荐算法中，提到了将用户-商品矩阵进行分解。从而实现对未打分项进行打分。矩阵分解是指将一个矩阵分解成两个或者多个矩阵的乘积。对于上述的用户-商品矩阵(评分矩阵)，记为Vm×nV_{m\times n}。能够将其分解成两个或者多个矩阵的乘积，如果分解成 ...
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2017-08-10 10:06:09
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以下代码均为个人原创，如有疑问，欢迎交流。新浪微博：拾毅者本节内容：
pssm生成
pssm简化
标准的pssm构建
滑动pssm生成
在基于蛋白质序列的相关预测中，使用PSSM打分矩阵会得将预测效果大大提高，同时，如果使用滑动的PSSM，效果又会进一步提高。这里主要以分享代码为主，下面介绍下PSSM从生成到处理的全过程。1.PSSM的生成PSSM的生成有多种方式，这里使用的psiblast软件，n...
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2015-07-08 09:37:57
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