一、简介 基于matlab染色体计数 二、源代码 I = imread('chrimage.bmp'); figure,imshow(I); I2 = rgb2gray(I); s = (I2); I4 = 255*ones(s(1), s(2), 'uint8'); I5 = imsubtract ...
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2021-06-28 20:54:17
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DNA-蚕丝（脱氧核糖核酸Deoxyribonucleic acid）双螺旋→组成染色体 AGTC RNA-丝线(核糖核酸（Ribonucleic Acid）) AGCU 引导蛋白质合成 染色体-x形毛线玩具（inside the 细胞核-my玩具仓库 信息的海洋啊hhhhh） 基因-~~~~~~~ ...
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2021-04-21 12:20:50
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前言 该算法旨在在一组数据点中，用基因表达式编程的方法，根据基因遗传定律，物竞天择、优者生存，劣者淘汰的思想，不断进化种群，找出适宜度最高的染色体来模拟出数据点之间所存在的数学表达式关系。通常该算法用来解决符号回归问题：符号回归（Symbolic Regression）作为一种一种监督学习方法，试图 ...
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2021-04-08 13:48:32
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目的： 经常需要对信息分析中的结果文件进行分析，有时可能期望提取指定染色体范围内，指定区间内的文件。 代码： #!/bin/bash echo -e "\033[32m\n地球是圆的，而看似像终点的地方可能也只是起点。\n \033[0m" # 如果不指定输入结果名称，使用默认名称 outfile= ...
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2020-06-11 13:51:05
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[TOC] 粒子群算法（PSO）和遗传算法(GA)都是优化算法，都力图在自然特性的基础上模拟个体种群的适应性，它们都采用一定的变换规则通过搜索空间求解。 PSO和GA的相同点 1. 都属于仿生算法。PSO主要模拟鸟类觅食、人类认知等社会行为而提出；GA主要借用生物进化中“适者生存”的规律。 2. 都 ...
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2020-05-18 01:08:57
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circos 是一款perl 语言开发的画图软件，提供了染色体相关数据的一种可视化方式。其制作的图表精美，被科研工作者广泛使用。Circos可以对染色体相关数据进行可视化，以每条染色体为一个扇区，组成一个圆形，如图1所示。也可以对其他表格形式的数据进行可视化，以每个样本作为扇区，以其上的特征作为图形 ...
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2020-05-10 13:07:50
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# vep # 使用vep对manta结果进行注释 # manta结果是染色体结构变异(SV),这里使用vep进行注释 # vep官方说明文档： # http://asia.ensembl.org/info/docs/tools/vep/script/vep_tutorial.html # 安装 c ...
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2020-04-16 10:30:17
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GTF 全称是gene transfer format，主要是对染色体上的基因进行标注。怎么理解呢，其实所谓的基因名，基因座等，都只是后来人们给一段DNA序列起的名字而已，还原到细胞中就是细胞核里面的一条长长的染色体（DNA序列）。而这个GTF文件的主要功能，就是指出我们所谓的基因在染色体上的位置（ ...
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2020-03-17 14:20:40
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bed文件（browse extensive data）以及gff文件（general fearture format） bed文件 第一列是染色体或者contig信息。 第二列是起始位置，从0开始。 第三列是终止位置。 第四列是bed列的名字。 第五列是score。 第六列是链方向。 第七列是基因 ...
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2020-03-09 16:19:25
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“核小体”是染色体的基本结构单位。4种组蛋白，各2个组成一个8聚体，DNA链再缠绕上去，就形成核小体了。每个组蛋白肽链都有氮端和碳端两个“尾巴”，这些“尾巴”上的氨基酸可以被加上一些化学基团，即“修饰”。 From：https://www.jianshu.com/p/154d268819da 绿色 ...
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2020-02-21 20:18:48
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