SRAtoolkit download .fa fastqc STAR samtools index visualize DEseq2: differential expression prepare: featureCounts count reads normalizion ...
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2018-11-21 22:23:44
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#!/usr/bin/envpython2#-*-coding:utf-8-*-"""CreatedonSatSep1510:54:532018@author:myhaspl@email:myhaspl@myhaspl.com读取多个文件"""importtensorflowastfimportosvalidateCount=10sampleCount=10testCount=10g=tf.Gra
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2018-11-21 21:08:15
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1.介绍鸿鹄云架构【服务监控中心】提供简洁的可视化WEBUI,来管理SpringCloud微服务应用程序。2.平台基础功能服务在线状态监控、Logging日志级别管理、JMXbeans管理、Threads会话和线程管理、Trace应用请求跟踪应用运行参数信息更多资源欢迎球911708498Java系统属性、Java环境变量属性、内存信息、Spring环境属性SpringCloud其他组件监控如:当
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2018-11-20 19:42:12
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python基础之进程、线程、协程 引子 进程 线程(优先阅读) 协程 进程 概念:就是一个程序在一个数据集上的一次动态执行过程(本质上来讲,就是运行中的程序(代指运行过程),程序不运行就不是进程) 抽象概念 组成: 1、程序:我们编写的程序用来描述进程要完成哪些功能以及如何完成 2、数据集:数据集 ...
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2018-11-16 13:30:54
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一、GIL锁 1. 什么是GIL全局解释器锁 GIL本质就是一把互斥锁,相当于执行权限,每个进程内都会存在一把GIL,同一进程内的多个线程 必须抢到GIL之后才能使用Cpython解释器来执行自己的代码,即同一进程下的多个线程无法实现并行 但是可以实现并发 在Cpython解释器下,如果想实现并行可 ...
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2018-11-12 21:46:05
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1、需要的安装包下载mkdir-p/home/toolscd/home/tools/wgethttp://luajit.org/download/LuaJIT-2.0.2.tar.gzwgethttps://github.com/openresty/lua-nginx-module/archive/v0.10.9rc7.tar.gzwgethttps://github.com/simpl/ngx_
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2018-11-11 23:28:21
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paired-end reads的拼接 发表于2012 年 8 月 13 日 Velvet中paired-end reads的拼接 文件格式 要将两头测序(paired-end)的reads放到同一个文件当中,fastq格式,必须成对的依次放置reads [interleaved],velvet是成 ...
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2018-11-10 15:56:46
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RNA-seq数据综合分析教程 2 4,055 A+ 所属分类:Transcriptomics 收 藏 2 RNA-seq数据分析 mRNA-seq是目前最常用的高通量测序技术,一般的用法就是看看基因表达谱,寻找差异表达的基因。我和高通量测序数据分析结缘,也是因为RNA-seq。 一开始我对mRNA ...
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2018-11-10 12:58:26
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HISAT2,StringTie,Ballgown处理转录组数据 本文总阅读量次2017-05-26 HISAT2,StringTie,Ballgown处理转录组数据思路如下: 数据质控 将RNA-seq的测序reads使用hisat2比对 samtools将sam文件转成bam,并且排序,为下游分 ...
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2018-11-09 22:03:36
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分散读取与聚集写入 分散读取(scattering Reads):将通道中的数据分散到多个缓冲区中 聚集写入(gathering Writes):将多个缓冲区的数据聚集到通道中 分散读取 聚集写入 ...
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2018-11-09 00:50:05
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