关联分析 概念： 关联分析该方法是以长期重组后保留下来的基因（位点）间连锁不平衡（LD）为基础，在获得群体表型数据和基因型数据之后，采用统计方法检测遗传多态性和性状可遗传变异之间的关联，目标是寻找性状变异的基因组功能型变异（基因位点和标记位点） 关联分析是基于无亲缘关系的病例组和对照组在某一个遗传位 ...
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2017-02-14 21:31:05
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可以在对中对元素进行配对和交换的线程的同步点。每个线程将条目上的某个方法呈现给 exchange 方法，与伙伴线程进行匹配，并且在返回时接收其伙伴的对象。Exchanger 可能被视为 SynchronousQueue 的双向形式。Exchanger 可能在应用程序（比如遗传算法和管道设计）中很有用 ...
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2017-02-10 01:57:33
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进化计算领域中优势个体的选择方法 I ： 轮盘赌选择 Roulette Wheel Selection 这是一种基于比例的选择。由于随机操作的原因，误差较大，有时即便适应度较高的个体也选择不上 II: 锦标赛选择 Tournament Selection 每次选取几个个体中适应度最高的一个个体遗传到 ...
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2017-02-10 01:30:34
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Word害我重写=_=顺便重新整理下思路 背景：写论文时用到遗传算法，花了近一周时间，还算理解了算法以及能够进行基础的编程实现（保持谦虚）。 说明：具体的实现没敢细讲，主要是原理的方法上的介绍（讲解都算不上）。 先说说算法学习，个人觉得首先需要了解这个算法是拿来干嘛的，然后学习它的理论原理，多看懂几 ...
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2017-02-09 21:18:57
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代码地址：https://github.com/guojun007/binary_sga 种群初始化: binary_sga/population_init/population_init.py 选择操作：（轮盘赌选择） binary_sga/selection/selection.py 交叉操作： ...
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2017-02-05 13:50:21
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面向对象：不了解原理的情况下，会使用功能，不关注内部细节，是一种通用思想 对象：黑盒子 不了解内部的结构，知道表面的各种操作 面向对象编程OOP： 特点：抽象（抓住核心问题）， 封装（不考虑内部实现，只考虑功能）， 继承（遗传 父母和孩子 从父类继承出一些属性和方法，还可以 有自己的新方法） 多重继 ...
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编程语言 时间：
2017-01-24 20:15:33
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这是Trends in Ecology & Evolution上的一篇新review，这个期刊影响因子超过10，在生态学里还是非常有分量。我的研究生课题是关于进化的，属于分子生态，群体遗传学，蹭着热点做表观遗传。这么简洁的题目，立刻吸引了我，不过我没看懂supply和demand究竟是什么意思？因为 ...
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2017-01-20 07:39:04
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参考这篇文章，写的不错。 http://www.cnblogs.com/heaad/archive/2010/12/23/1914725.html 另外上一篇文章说了模拟退火算法。 遗传算法 ( GA , Genetic Algorithm ) ，也称进化算法 。 遗传算法是受达尔文的进化论的启发， ...
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2017-01-16 14:08:40
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遗传算法中的交叉操作是 对NSGA-II 源码分析的 最后一部分， 这一部分也是我 从读该算法源代码和看该算法论文理解偏差最大的 函数模块。 这里，首先提一下，遗传算法的 交叉操作、变异操作都是需要设定概率的， 即交叉概率和变异概率。 假设种群个体 大小为 popsize , 那么交叉操作需要进行 ...
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编程语言 时间：
2017-01-09 23:52:07
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report_pop 将种群中所有个体的 目标函数值， 限制条件值， 编码值 打印出来。 report_pop 种群中的非支配个体并且限制条件总和为0 （constr_violation == 0.0）的个体的 目标函数值， 限制条件值， 编码值 打印出来。 ...
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2017-01-08 19:04:34
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