1. 配置防火墙 正确配置防火墙的过滤规则，否则会造成NFS文件系统的挂载失败，NIS账户认证的失败，mpirun远程任务实例投放的失败。一般情况下，计算集群是在内部局域网中使用，所以可以不用太顾及安全问题，直接关闭掉所有节点服务器的防火墙即可。 相关命令如下： 2. 配置集群局域网ip与主机名的映 ...
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2016-06-16 17:52:55
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1. 下载OpenMPI 在官网上下载最新版本的安装包， https://www.open-mpi.org/software/ompi/v1.8/downloads/openmpi-1.8.4.tar.gz 2. 解压并进行配置 注意最后一行是将其安装到 /usr/local/openmpi目录下，
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2016-03-23 17:14:06
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MIC C编程（offload模式） 编程特点 简单---隐藏大量细节，语法与OpenMPI类似（不需要开辟空间） 灵活---OpenMP MPI（但是用的不多）pThread等多种方式 传统---与CPU编程一脉相承 MIC C扩展语言结构 编译指导方式（#pragma） offload --表示
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2016-02-11 16:49:53
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来源http://www.open-mpi.org/网络连接SSH连接，保证各台机器之间可以无密码登陆，此处不展开hosts文件如下1 #/etc/hosts2 192.168.0.190 master3 192.168.0.189 slave14 192.168.0.81 slave...
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2016-01-16 18:59:33
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话说ML进化树如果要进行高bootstrap值的验证的话对于计算能力要求是很高的。不并行做基本不可能。所以下了一个RAxML，在linux下有好几种编译方式，看了一下手上的机器支持AVX指令集，所以选择AVX-MPI方式吧。先安装openmpi，照网上教程编译就行，就是略慢。但是安装完mpicc之后...
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2016-01-03 20:51:13
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MPI在windows上的扯淡 MPI的实现一般使用MPICH与OpenMPI，这两个库在12年的版本就已经停止了对windows的更新，不支持MPI的新特性（也不知道有没有bug方面的问题），配置的时候教程较少，配置也出现了一些不好解决的问题。吐槽一下，MPICH官方不对Windows更新的原因是...
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2015-11-18 12:06:33
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人脸关键点定位；视频行为识别；caffe multi-gpu with openmpi...
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2015-07-14 15:35:16
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1. Cython是什么？它是一个用来快速生成Python扩展模块(extention module)的工具语法是Python和c的混血Cython作为一个Python的编译器，在科学计算方面很流行，用于提高Python的速度，通过OpenMPI库还可以进行吧并行计算。2. Cython安装（Win...
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2015-04-26 22:22:21
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主要安装步骤分为如下5步，看完这些后，回过头去看安装包里的INSTALL文件，收获会更多。
下载、解压openmpi到官网下载最新版本后、解压tar -xvf openmpi-xxx
cd openmpi-xxx配置，- -prefix选项表示安装目录./configure --prefix="/opt/openmpi"Build 安装, -j 选项表示编译使用的核心数make -j 4 all
有...
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2015-04-17 18:15:25
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1.进程+线程，进程绑定跟CPU利用率关系
OpenMPI 可以通过多个参数来指定进程的绑定情况。集群单个计算节点往往包含多个物理CPU，每个物理CPU上包括多个物理核心，现在的处理器多支持超线程，所以物理核心又可以分为两个逻辑核心。假设有一个计算节点，包含2个物理CPU，每个CPU上6个核，支持超线程：在使用进程加线程编程时，若使用"mpirun -1 --bind-to-socket -...
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2015-04-12 17:47:49
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