1、Variant Call Format(VCF) Example 2、Gene Predictions (Extended)(GPD) The following definition is used for extended gene prediction tables. In alterna ...
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2017-08-17 17:21:32
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le final.snp.list | perl -lane '{$a+=1;print "$a\t$F[0]\t$F[1]\t$F[1]"}' | less >snp_site le final.indel.vcf |grep -v '^#' | less -S|perl -lane '{$a+= ...
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2017-08-14 11:28:56
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出现这种问题说明vcf文件不足8个分割制表符,比如像如下文件: 为了解决这个问题,说明在做snp filter时候,需要提取至少8个制表符的字符串,比如,像如下文件所示: ...
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2017-07-20 17:26:10
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ANNOVAR是一个perl编写的命令行工具,能在安装了perl解释器的多种操作系统上 执行。允许多种输入文件格式,包括最常被使用的VCF格式。输出文件也有多种格式,包括注释过的VCF文件、用tab或者逗号分隔的text文件。 ANNOVAR能快速注释遗传变异并预测其功能。类似的variants注释 ...
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2017-06-22 13:54:12
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前段时间我哥备份手机通讯录备份的是xls表格格式,然后如今导入不进去了,用各种软件都是错误。我导出为vcard的(后缀是vcf),以文本格式打开看了下。发现vcard是非常有格式规范的。顿时认为有戏了。能够尝试将excel表格转换成vcard格式。然后导入。 BEGIN:VCARD N:;移动客服; ...
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2017-06-01 16:45:27
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vcf, 通讯录导出的一种格式。一。生成vcf文件假设要把我们iPhone通讯录里的数据, 生成vcf格式文件。我们能够借助iCloud。 小技巧:通过iCloud导出iPhone通讯录的方法当然, 假设你想在应用中, 利用代码生成, 全然能够。先导出通讯录数据, 再解析, 再生成vcf文件就可以。 ...
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移动开发 时间:
2017-05-27 20:42:18
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最近在做iOS系统通讯录备份到服务器,并且可以从服务器中下载备份文件恢复到手机的功能,部分实现细节记录如下。 将iphone系统通讯录生成.vcf文件 运行后系统沙盒Document目录下会生成contacts.vcf文件,上传至服务器即可。 通讯录恢复: 从服务器下载contents.vcf文件, ...
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2017-05-27 17:10:57
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samtools的mpileup命令是一个samtools中一个很重要的命令。它的主要功能主要是生成BCF、VCF文件或者pileup一个或多个bam文件。比对记录以在@RG中的样本名作为区分标识符。如果样本标识符缺失,那么每一个输入文件则视为一个样本。 在pileup格式中(没有-u或者-g参数) ...
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2017-03-24 20:30:18
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这里可以调用一个jq-qrcode库,然后根据参数往里面传内容即可,本人当时做的是一个名片系统,所以可以生成一个vcf文件在PC端。 具体项目文件请见:https://github.com/marhovey/QRcode; jq-qrcode直接访问:https://github.com/jerom ...
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2017-03-14 10:42:03
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scrapy的安装 指定国内源安装 pip install virtualenv -i http://pypi.douban.com/simple --trusted-host pypi.douban.com 出现错误: failed to compile wheel 根据提示去微软官网下载 VCf ...
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2016-12-23 16:29:38
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