码迷,mamicode.com
首页 >  
搜索关键字:vcf    ( 76个结果
VCF文件详细信息
分类:数据库   时间:2016-11-11 18:55:28    阅读次数:1237
vcf-tools 笔记
vcf-query: 通过 vcf-query 提取DP (reads depth). ...
分类:其他好文   时间:2016-11-08 08:04:19    阅读次数:709
将ini转换成 json
文件内容:[docker]un=192.12.32.12foe=10.1.2.3[mysql]mydb=172.2.3.1脚本内容:getJson(file): ConfigParserconfig cf=config.ConfigParser() cf.read(file) sdf=cf.sections() dic={} xsdf: status=k,vcf.items(x): status==: dic[x]={k:v} status+=: dic[x][k]=v status=di..
分类:Web程序   时间:2016-10-25 19:53:13    阅读次数:270
GATK3.2.2小结(转载)
http://blog.csdn.net/skenoy/article/details/38346489 经过几天的摸索和网上资料的查询对GATK软件有点小心得,现总结如下: 1. fasta文件最好用定位到染色体上的数据,可以不用注释VCF文件(GVF),但如果用VCF文件保证以下几个条件: 1) ...
分类:其他好文   时间:2016-09-30 12:25:37    阅读次数:177
pysam - 多种格式基因组数据(sam/bam/vcf/bcf/cram/…)读写与处理模块(python)
在开发基因组相关流程或工具时,经常需要读取、处理和创建bam、vcf、bcf文件。目前已经有一些主流的处理此类格式文件的工具,如samtools、picard、vcftools、bcftools,但此类工具集成的大多是标准功能,在编程时如果直接调用的话往往显得不够灵活。 本文介绍的是一个处理基因组数... ...
分类:编程语言   时间:2016-09-26 14:31:54    阅读次数:570
Atitit.常见软件 数据 交换格式 标准
Atitit.常见软件 数据 交换格式 标准 1. 常见的数据格式txt ,doc ,pic,music ,vodio1 2. 通用格式json yaml phpstr1 3. 专用格式1 4. 用户信息vcf 通讯录导出的一种格式1 5. News ,rss vs atom2 6. 商品信息exc ...
分类:其他好文   时间:2016-09-01 07:06:38    阅读次数:164
maven将本地jar包导入本地仓库
从maven中央仓库下载下来的jar包手动导入本地库,如下图 以下其中maven的dependency <dependency> <groupId>org.molgenis</groupId> <artifactId>molgenis-data-vcf</artifactId> <version>1 ...
分类:编程语言   时间:2016-06-15 18:48:45    阅读次数:181
向Android模拟器中批量导入通讯录联系人
使用adb命令向Android模拟器中批量导入通讯录联系人的方法: 使用adb提供的命令, 可以非常方便地从PC中将通讯录批量导入android模拟器中. 首先要先准备好固定格式的vcf文件, 该文件即android中的通讯录存储格式文件. 格式如下: 导入的命令如下: 1 // 清除原通讯录联系人 ...
分类:移动开发   时间:2016-06-12 12:19:22    阅读次数:1186
操作VCF卡片信息的第三方jar包:ez-vcard
ez-vcardhttps://github.com/mangstadt/ez-vcard目前最新的版本已经更新到0.9.8起初使用该jar包的时候,是0.9.3,当时遇到一个很尴尬的问题,就是在将联系人转化为vcf卡片文件之后,用Android手机原生的vcf导入联系人的功能进行导入,结果是不支持...
分类:编程语言   时间:2015-12-07 15:38:01    阅读次数:205
76条   上一页 1 2 3 4 5 6 ... 8 下一页
© 2014 mamicode.com 版权所有  联系我们:gaon5@hotmail.com
迷上了代码!