vcf-query: 通过 vcf-query 提取DP (reads depth). ...
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其他好文 时间:
2016-11-08 08:04:19
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709
文件内容:[docker]un=192.12.32.12foe=10.1.2.3[mysql]mydb=172.2.3.1脚本内容:getJson(file):
ConfigParserconfig
cf=config.ConfigParser()
cf.read(file)
sdf=cf.sections()
dic={}
xsdf:
status=k,vcf.items(x):
status==:
dic[x]={k:v}
status+=:
dic[x][k]=v
status=di..
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Web程序 时间:
2016-10-25 19:53:13
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270
http://blog.csdn.net/skenoy/article/details/38346489 经过几天的摸索和网上资料的查询对GATK软件有点小心得,现总结如下: 1. fasta文件最好用定位到染色体上的数据,可以不用注释VCF文件(GVF),但如果用VCF文件保证以下几个条件: 1) ...
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其他好文 时间:
2016-09-30 12:25:37
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177
在开发基因组相关流程或工具时,经常需要读取、处理和创建bam、vcf、bcf文件。目前已经有一些主流的处理此类格式文件的工具,如samtools、picard、vcftools、bcftools,但此类工具集成的大多是标准功能,在编程时如果直接调用的话往往显得不够灵活。 本文介绍的是一个处理基因组数... ...
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编程语言 时间:
2016-09-26 14:31:54
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570
Atitit.常见软件 数据 交换格式 标准 1. 常见的数据格式txt ,doc ,pic,music ,vodio1 2. 通用格式json yaml phpstr1 3. 专用格式1 4. 用户信息vcf 通讯录导出的一种格式1 5. News ,rss vs atom2 6. 商品信息exc ...
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其他好文 时间:
2016-09-01 07:06:38
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164
从maven中央仓库下载下来的jar包手动导入本地库,如下图 以下其中maven的dependency <dependency> <groupId>org.molgenis</groupId> <artifactId>molgenis-data-vcf</artifactId> <version>1 ...
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编程语言 时间:
2016-06-15 18:48:45
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使用adb命令向Android模拟器中批量导入通讯录联系人的方法: 使用adb提供的命令, 可以非常方便地从PC中将通讯录批量导入android模拟器中. 首先要先准备好固定格式的vcf文件, 该文件即android中的通讯录存储格式文件. 格式如下: 导入的命令如下: 1 // 清除原通讯录联系人 ...
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移动开发 时间:
2016-06-12 12:19:22
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1186
ez-vcardhttps://github.com/mangstadt/ez-vcard目前最新的版本已经更新到0.9.8起初使用该jar包的时候,是0.9.3,当时遇到一个很尴尬的问题,就是在将联系人转化为vcf卡片文件之后,用Android手机原生的vcf导入联系人的功能进行导入,结果是不支持...
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编程语言 时间:
2015-12-07 15:38:01
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205