Sed是一种流编辑器,过滤和替换文本工作原理:简单的来说,Sed一次处理一行内容。处理时,把当前处理的行存储在临时缓冲区中,称之为“模式空间”(patternspace),接着用sed命令处理缓冲区中的内容,处理完成后,把缓冲区的内容送往屏幕。接着处理下一行。直到文件末尾。语法..
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2017-09-03 23:55:38
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三大文本处理工具:grep,sed(流编辑器),awk(报告文本生成器) sed基本用法:sed是一种流编辑器,它是文本处理中非常中的工具,能够完美的配合正则表达式使用,功能不同凡响。处理时,把当前处理的行存储在临时缓冲区中,称为“模式空间”(pattern space),接着用sed命令处理缓冲区 ...
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2017-09-01 14:27:37
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挑战:寻找新的处理海量数据和复杂性的方法。 生信:说了什么: 研究对象: 以核酸、蛋白质等生物大分子数据库 研究手段方法:数学、信息学、计算机科学 研究工具: 计算机硬件、软件、计算机网络 研究目的: 对浩如烟海的原始数据进行获取、加工、存储、分配、分析、管理、注释解释,使之成为具有明确生物意义的生 ...
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2017-08-31 14:34:08
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import java.sql.Timestamp;import java.text.ParseException;import java.text.SimpleDateFormat;import java.util.Calendar;import java.util.Date;import jav ...
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2017-08-30 15:46:34
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LVM逻辑卷管理PV(物理卷)PV物理卷就是指硬盘分区或从逻辑上与磁盘分区具有同样功能的设备不如RAID,是LVM的基本存储逻辑块,但和基本的物理存储介质(如分区磁盘等)比较,却包含与LVM相关的管理参数。VG(卷组)LVM卷组类似与非LVM系统中的物理硬..
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2017-08-28 19:59:09
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文件排序 seq: 产生一系列的数字; man seq查看其具体使用。我们这使用seq产生下游分析所用到的输入文件。 # 产生从1到10的数,步长为1 $ seq 1 10 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 # 产生从1到10的数,步长为1,用空格分割 $ seq -s ' ' 1 10 1 ...
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2017-08-26 22:14:02
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工具名称描述 appletviewer.exe 用于运行并浏览applet小程序。 apt.exe 注解处理工具(Annotation Processing Tool),主要用于注解处理。 extcheck.exe 扩展检测工具,主要用于检测指定jar文件与当前已安装的Java SDK扩展之间是否存 ...
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2017-08-26 22:09:01
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sed用法一、sed简介sed是一种在线编辑器,它一次处理一行内容!!!处理时,把当前处理的行存储在临时缓冲区中,称为“模式空间”(patternspace),接着用sed命令处理缓冲区中的内容,处理完成后,把缓冲区的内容送往屏幕。接着处理下一行,这样不断循环,直到文件末尾。如果没有..
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2017-08-26 18:41:51
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预处理阶段 预处理阶段主要做两件事情: 一是将数据导入处理工具。通常来说,建议使用数据库,单机跑数搭建MySQL环境即可。如果数据量大(千万级以上),可以使用文本文件存储+Python操作的方式。 二是看数据。这里包含两个部分:一是看元数据,包括字段解释、数据来源、代码表等等一切描述数据的信息;二是 ...
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2017-08-24 19:48:26
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在大家刚接触Linux操作系统,首先都会让你了解linux的哲学思想:一切皆文件;那么今天就带大家认识linux中的一些文本查看工具。1、cat和tac连接文件并在标准输出上打印;其中cat是正向显示;tac是倒着显示格式:cat[options]...[FILE]...选项:-Efilename能看到行的结束符-Afil..
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2017-08-21 00:12:18
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