使用humann2: 参考晨宇大大的学习文档 HUMAnN2是描述微生物代谢通路的。使用宏基因组或宏转录组的序列信息。 http://huttenhower.sph.harvard.edu/humann2 安装的顺序是:Bowtie2 > Metaphlan2 > HUMAnN2 (个人建议安装an ...
分类:
其他好文 时间:
2016-12-08 09:59:21
阅读次数:
866
markdown 什么是markdown: Markdown是一种可以使用普通文本编辑器编写的标记语言,通过简单的标记语法,它可以使普通文本内容具有一定的格式。 Markdown具有一系列衍生版本,用于扩展Markdown的功能(如表格、脚注、内嵌HTML等等),这些功能原初的Markdown尚不具 ...
分类:
其他好文 时间:
2016-12-02 22:45:24
阅读次数:
878
本节内容 一、 Python介绍 python的创始人为吉多·范罗苏姆(Guido van Rossum)。1989年的圣诞节期间,吉多·范罗苏姆为了在阿姆斯特丹打发时间,决心开发一个新的脚本解释程序,作为ABC语言的一种继承。 最新的TIOBE排行榜,Python赶超PHP占据第五, Python ...
分类:
编程语言 时间:
2016-11-29 21:20:45
阅读次数:
244
matplotlib是python上的一个2D绘图库,它可以在夸平台上边出很多高质量的图像。综旨就是让简单的事变得更简单,让复杂的事变得可能。我们可以用matplotlib生成 绘图、直方图、功率谱、柱状图、误差图、散点图等 。 matplotlib的发明人为John Hunter(1968-201... ...
分类:
其他好文 时间:
2016-11-12 11:48:02
阅读次数:
190
手把手教你搭建caffe及手写数字识别作者:骁哲、李伟、小蔡、July说明:时间:一、前言 在前面的教程中,我们搭建了tensorflow、torch,教程发布后,大家的问题少了非常多。但另一大...
分类:
其他好文 时间:
2016-11-09 17:41:44
阅读次数:
648
摘要 一、创建对象 二、查看数据 三、选择和设置 四、缺失值处理 五、相关操作 六、聚合 七、重排(Reshaping) 八、时间序列 九、Categorical类型 十、画图 十一、导入和保存数据 ...
分类:
编程语言 时间:
2016-11-06 02:21:39
阅读次数:
425
》将python安装目录中的script的目录导入到环境变量path中》在Windows的DOS窗口执行:pip》》将出现pip的相关信息》在Windows中的DOS界面中执行:pipinstallnump》》系统会自动下载nump包,并且完成相应的安装》》因为,我已经安装过啦,所以不会出现下载的进度条(注:下载比..
分类:
编程语言 时间:
2016-11-05 15:14:30
阅读次数:
266
这两天为了搭载深度学习的Python架构花了不少功夫,但是Theano对Python以及nunpy的版本都有限制,所以只能选用版本较新的python和nunpy以确保不过时。但是最新版Python和最新版numpy有点不完善,很多安装步骤都要在命令行里完成,所以花了我很多时间,为了祭奠我安装nump ...
分类:
编程语言 时间:
2016-08-19 13:03:13
阅读次数:
332
RuntimeWarning: overflow encountered in ubyte_scalars问题分析:ubyte_scalars出现溢出,定位到具体的代码: val = img[y1_, x1_] - img[y2_, x2_] 这段代码的目的是为了计算两个像素的差值,img是nump ...
分类:
编程语言 时间:
2016-06-08 10:43:01
阅读次数:
823