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Output
Sample Input
3 2 GATACCAGATACCAGATACCAGATACCAGATACCAGATACCAGATACCAGATACCAGATA AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA 3 GATACCAGATACCAGATACCAGATACCAGATACCAGATACCAGATACCAGATACCAGATA GATACTAGATACTAGATACTAGATACTAAAGGAAAGGGAAAAGGGGAAAAAGGGGGAAAA GATACCAGATACCAGATACCAGATACCAAAGGAAAGGGAAAAGGGGAAAAAGGGGGAAAA 3 CATCATCATCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC ACATCATCATAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA AACATCATCATTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTT
Sample Output
no significant commonalities AGATAC CATCATCAT
题目大意：
给出一个DNA碱基序列的集合，确定在所有序列中都出现的最长的碱基序列！
说一下输出的问题吧：输出最长的相同的碱基子序列，如果最长的相同的碱基子序列的长度小于3，则输出那一串英文；如果相同的最长长度的子序列有多个，则仅输出按字典序排序的第一个即可！
这个题我用的是BF算法，很黄很暴力的说！
但是由于字符串的长度仅为60，所以不用担心超时的问题了！
这个题我使用了#include<cstring>头文件里的几个函数-->strncpy（）,strstr（）,strcpy（）这三个函数不知道的话可以百度下，这样同时可以加深自己对这三个函数的理解！至于是干什么的，下面的代码里我会有注释的！
这样写起来，方便得多，代码看起来也一目了然，不会太繁琐、枯燥！
代码如下：（关键步骤都是有详细的注释的！）
#include<stdio.h>
#include<string.h>
#include<iostream>
using namespace std;
int main()
{
int T,m;
char ss[13][520];
cin>>T;
while(T--)
{
cin>>m;
for(int i=0; i<m; i++)
cin>>ss[i];
char str[520],te[520];//te[]为临时字符串！
int len=strlen(ss[0]);
int maxlong=0;//设当前最长公共字串为0！
for(int i=0; i<len; i++)
{
//由于要求最长字符串长度必须大于3，所以j=i+2；
for(int j=i+2; j<len; j++)
{
int telen=j-i+1;//临时字符串长度！
strncpy(te,ss[0]+i,telen);//这个函数作用是复制指定长度的字符串字串！
te[telen]='\0';
int flag=0;//标记te字符串是不是p[1]到p[m-1]的公共字串！
for(int k=1; !flag&&k<m; k++)
{
//如果未找到
if(strstr(ss[k],te)==NULL)
flag=1;//strstr函数是搜索一个字符串在另一个字符串中是否第一次出现！如果没出现过则返回null或者false！
}//这个函数前后的参数分别是strstr（另一个字符串首地址，一个字符串首地址）！
if(!flag)//搜索到了！
if(telen>maxlong||(telen==maxlong&&strcmp(te,str)<0))//按字典序排序！
{
maxlong=telen;
strcpy(str,te);
}
}
}
if(maxlong>=3)
cout<<str<<endl;
else
cout<<"no significant commonalities"<<endl;
}
return 0;
}
#include<cstring>
#include<stdio.h>
#include<iostream>
using namespace std;
const int maxn = 70;
char b[10][maxn], p[maxn];
int n, ma, lenp, next[maxn];
void kk()
{
int i = 0, j = -1;
next[0] = -1;
while(i < lenp)
{
if(j == -1 || p[i] == p[j])
{
i ++; j ++;
next[i] = j;
}
else j = next[j];
}
int k, m;
ma = 100;
for(int k = 1; k < n; k ++)
{
i = 0; j = 0; m = 0;
while(i < 60 && j < lenp)
{
if(j == -1 || b[k][i] == p[j])
{
i ++; j ++;
}
else j = next[j];
if(j > m) m = j;
}
if(m < ma) ma = m;
}
}
int main()
{
int t;
char a[maxn];
scanf("%d", &t);
while(t --)
{
scanf("%d", &n);
for(int i = 0; i < n; i ++)
scanf("%s", b[i]);
int ans = 0;
for(int i = 0; i <= 57; i ++)
{
strcpy(p, b[0] + i);
lenp = 60 - i;
kk();
if(ans < ma)
{
ans = ma;
strncpy(a, b[0] + i, ans);
a[ans] = '\0';
}
else if(ans == ma)
{
char tmp[maxn];
strncpy(tmp, b[0] + i, ans);
tmp[ans] = '\0';
if(strcmp(tmp, a) < 0)
strcpy(a, tmp);
}
}
if(ans >= 3)
printf("%s\n", a);
else
printf("no significant commonalities\n");
}
return 0;
}
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原文地址：http://blog.csdn.net/u014004096/article/details/37827789
