统计fastq文件中读段的数量

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mycount=`cat SRR108114_new_1.fastq | wc -l`
echo ‘Number of clean reads, SRR108114_new_1.fastq: ‘$((mycount/4)) >> SRR108114.stat
mycount=`cat SRR108114_new_2.fastq | wc -l`
echo ‘Number of clean reads, SRR108114_new_2.fastq: ‘$((mycount/4)) >> SRR108114.stat

统计fastq文件中读段的数量

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原文地址：http://www.cnblogs.com/emanlee/p/4826928.html