Medical Image Process_NIfTI 文件头文件解析

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1. NIfTI是常见的医学图像格式文件之一。标准的NIfTI的扩展名为.nii, 它里面包含了头文件以及图像资料；见下图所示：

hdr 是此文件的头文件；

filetype: 0--Analyze format (.hdr/.img);  1--NIfTI format(.hdr/.img);  2---NIfTI format(.nii)

img: 是图像数据；

fileprefix: 本NIfTI文件名（未加扩展名）

本文这里主要来讲讲这个头文件hdr里面包含的内容：（参考： http://nifti.nimh.nih.gov/pub/dist/src/niftilib/nifti1.h）

其中，hk这个结构体里面的元素如下图所示：

从定义可知，sizeof_hdr必须为348；后面连续5个变量没有用到，dim_info是MRI slice ordering, 总之，这个里面提供的信息不多；

dime里面存放的元素如下所示：

dim[8] 存放的是医学图像数据矩阵的维度： 本例为4（表示图像数据是四维数据）    256    256    11    25    1    1    1 （第2-5位有用），因为最多支持7维的图像数据，因此这里dim的维度为8.第一维度存放图像数据的总维度。

pixdim[8] ---voxel width along dimension #i, i=1...dim[0];  本例中为： 0    1.484  1.484    10    1    1    1    1

目前我所知道的，就是生成 .hdr文件的时候，需要提供 体素大小（voxel size）, 原点（originator）这两个信息， 不知道可对。 其他的参数以后再做了解。

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原文地址：http://www.cnblogs.com/zhao441354231/p/5270097.html