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题意：给定m个长度为n的DNA序列，求一个最短的DNA序列，使得总Hamming距离最小。
Hamming距离等于字符不同的位置个数。
析：看到这个题，我的第一感觉是算时间复杂度，好小，没事，完全可以暴力，只要对每个串的同一个位置，
都选出现最多的，如果有一样的选ASIIC码小的（因为要求字典序小）。然后记录最字符和Hamming距离即可。
代码如下：
#include <iostream>
#include <cstdio>
#include <algorithm>
#include <queue>
#include <vector>
using namespace std;
const int maxn = 1000 + 10;
char s[55][maxn];
char ans[maxn];
int main(){
int n, T, m, d, mm; cin >> T;
while(T--){
scanf("%d %d", &m, &n);
for(int i = 0; i < m; ++i)
scanf("%s", s[i]);
d = 0;
for(int i = 0; i < n; ++i){
int cnta = 0, cntc = 0, cntg = 0, cntt = 0;
mm = 0;
for(int j = 0; j < m; ++j){
if(‘A‘ == s[j][i]) ++cnta;
else if(‘C‘ == s[j][i]) ++cntc;
else if(‘G‘ == s[j][i]) ++cntg;
else if(‘T‘ == s[j][i]) ++cntt;
}
mm = max(mm, cnta); mm = max(mm, cntc);//查找谁最多多
mm = max(mm, cntg); mm = max(mm, cntt);
if(mm == cnta){ ans[i] = ‘A‘; d += cntc; d += cntg; d += cntt; }//不同位置加和
else if(mm == cntc){ ans[i] = ‘C‘; d += cnta; d += cntg; d += cntt; }
else if(mm == cntg){ ans[i] = ‘G‘; d += cntc; d += cnta; d += cntt; }
else if(mm == cntt){ ans[i] = ‘T‘; d += cntc; d += cntg; d += cnta; }
}
ans[n] = ‘\0‘;//加结束符
printf("%s\n%d\n", ans, d);
}
return 0;
}
LA 3602 DNA Consensus String （暴力枚举）
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原文地址：http://www.cnblogs.com/dwtfukgv/p/5543649.html
