求解两个字符串的最长公共子序列

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一，问题描述

给定两个字符串，求解这两个字符串的最长公共子序列（Longest Common Sequence）。比如字符串1：BDCABA；字符串2：ABCBDAB

则这两个字符串的最长公共子序列长度为4，最长公共子序列是：BCBA

二，算法求解

这是一个动态规划的题目。对于可用动态规划求解的问题，一般有两个特征：①最优子结构；②重叠子问题

①最优子结构

设 X=(x1,x2,.....xn) 和 Y={y1,y2,.....ym} 是两个序列，将 X 和 Y 的最长公共子序列记为LCS(X,Y)

找出LCS(X,Y)就是一个最优化问题。因为，我们需要找到X 和 Y中最长的那个公共子序列。而要找X 和 Y的LCS，首先考虑X的最后一个元素和Y的最后一个元素。

1）如果 xn=ym，即X的最后一个元素与Y的最后一个元素相同，这说明该元素一定位于公共子序列中。因此，现在只需要找：LCS(X_n-1，Y_m-1)

LCS(X_n-1，Y_m-1)就是原问题的一个子问题。为什么叫子问题？因为它的规模比原问题小。（小一个元素也是小嘛....）

为什么是最优的子问题？因为我们要找的是X_n-1 和 Y_m-1 的最长公共子序列啊。。。最长的！！！换句话说，就是最优的那个。（这里的最优就是最长的意思）

2）如果xn != ym，这下要麻烦一点，因为它产生了两个子问题：LCS(X_n-1，Y_m) 和 LCS(X_n，Y_m-1)

因为序列X 和 序列Y 的最后一个元素不相等嘛，那说明最后一个元素不可能是最长公共子序列中的元素嘛。（都不相等了，怎么公共嘛）。

LCS(X_n-1，Y_m)表示：最长公共序列可以在(x1,x2,....x(n-1)) 和 (y1,y2,...yn)中找。

LCS(X_n，Y_m-1)表示：最长公共序列可以在(x1,x2,....xn) 和 (y1,y2,...y(n-1))中找。

求解上面两个子问题，得到的公共子序列谁最长，那谁就是 LCS（X,Y）。用数学表示就是：

LCS=max{LCS(X_n-1，Y_m)，LCS(X_n，Y_m-1)}

由于条件 1)  和  2)  考虑到了所有可能的情况。因此，我们成功地把原问题 转化 成了 三个规模更小的子问题。

②重叠子问题

重叠子问题是啥？就是说原问题 转化 成子问题后，  子问题中有相同的问题。咦？我怎么没有发现上面的三个子问题中有相同的啊？？？？

OK，来看看，原问题是：LCS(X,Y)。子问题有 ?LCS(X_n-1，Y_m-1)    ?LCS(X_n-1，Y_m)    ?LCS(X_n，Y_m-1)

初一看，这三个子问题是不重叠的。可本质上它们是重叠的，因为它们只重叠了一大部分。举例：

第二个子问题：LCS(X_n-1，Y_m) 就包含了：问题?LCS(X_n-1，Y_m-1)，为什么？

因为，当X_n-1 和 Y_m 的最后一个元素不相同时，我们又需要将LCS(X_n-1，Y_m)进行分解：分解成：LCS(X_n-1，Y_m-1) 和 LCS(X_n-2，Y_m)

也就是说：在子问题的继续分解中，有些问题是重叠的。

由于像LCS这样的问题，它具有重叠子问题的性质，因此：用递归来求解就太不划算了。因为采用递归，它重复地求解了子问题啊。而且注意哦，所有子问题加起来的个数 可是指数级的哦。。。。

这篇文章中就演示了一个递归求解重叠子问题的示例。

那么问题来了，你说用递归求解，有指数级个子问题，故时间复杂度是指数级。这指数级个子问题，难道用了动态规划，就变成多项式时间了？？

呵呵哒。。。。

关键是采用动态规划时，并不需要去一 一 计算那些重叠了的子问题。或者说：用了动态规划之后，有些子问题 是通过 “查表“ 直接得到的，而不是重新又计算一遍得到的。废话少说：举个例子吧！比如求Fib数列。关于Fib数列，可参考：

求fib(5)，分解成了两个子问题：fib(4) 和 fib(3)，求解fib(4) 和 fib(3)时，又分解了一系列的小问题....

从图中可以看出：根的左右子树：fib(4) 和 fib(3)下，是有很多重叠的！！！比如，对于 fib(2)，它就一共出现了三次。如果用递归来求解，fib(2)就会被计算三次，而用DP(Dynamic Programming)动态规划，则fib(2)只会计算一次，其他两次则是通过”查表“直接求得。

说了这么多，还是要写下最长公共子序列的递归式才完整。借用网友的一张图吧：）

c[i,j]表示：(x1,x2....xi) 和 (y1,y2...yj) 的最长公共子序列的长度。（是长度哦，就是一个整数嘛）。公式的具体解释可参考《算法导论》动态规划章节

三，LCS JAVA实现

 1 public class LCSequence {
 2     
 3     //求解str1 和 str2 的最长公共子序列
 4     public static int LCS(String str1, String str2){
 5         int[][] c = new int[str1.length() + 1][str2.length() + 1];
 6         for(int row = 0; row <= str1.length(); row++)
 7             c[row][0] = 0;
 8         for(int column = 0; column <= str2.length(); column++)
 9             c[0][column] = 0;
10         
11         for(int i = 1; i <= str1.length(); i++)
12             for(int j = 1; j <= str2.length(); j++)
13             {
14                 if(str1.charAt(i-1) == str2.charAt(j-1))
15                     c[i][j] = c[i-1][j-1] + 1;
16                 else if(c[i][j-1] > c[i-1][j])
17                     c[i][j] = c[i][j-1];
18                 else
19                     c[i][j] = c[i-1][j];
20             }
21         return c[str1.length()][str2.length()];
22     }
23     
24     //test
25     public static void main(String[] args) {
26         String str1 = "BDCABA";
27         String str2 = "ABCBDAB";
28         int result = LCS(str1, str2);
29         System.out.println(result);
30     }
31 }

感觉整个代码就是直接根据上面的那个递归表达式写的。

①第5行定义一个数组来保存最长公共子序列的长度

②第6行至第9行是初始化。为什么初始化成0？ 因为： c[0,j]表示啥？表示字符串1的长度是0，字符串2的长度是j，这两个字符串的最长公共子序列的长度是？当然是0 喽。。。因为，字符串1 根本就没有嘛。

③第11行至第20行，就是递归表达式的程序表示。第16行至第19行，就是：  c[i,j] = max{c[i][j-1], c[i-1][j]}

④第21行返回最终结果。为什么是返回 c[str1.length()][str2.length()]？？？看看 c[i][j]表示什么意思，你就知道了。

四，参考资料

https://www.zhihu.com/question/23995189

http://www.cnblogs.com/huangxincheng/archive/2012/11/11/2764625.html

求解两个字符串的最长公共子序列

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原文地址：http://www.cnblogs.com/hapjin/p/5572483.html