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Hadoop序列化与压缩

时间:2016-08-17 23:25:38      阅读:241      评论:0      收藏:0      [点我收藏+]

标签:计算机系统   java   虚拟机   网络   通信   

传统的的计算机系统通过I/O操作与外界交流,,Hadoop的I/O由传统的I/O系统发展而来,但是又有些不同,Hadoop需要处理P、T级别的数据,所以在org.apache.hadoop.io包中包含了一些面向海量数据处理的基本输入输出工具,本文会对其中的序列化和压缩进行研究。

 

1 序列化

对象的序列化用于将对象编码成一个字节流,以及从字节流中重新构建对象。将一个对象编码成一个字节流称为序列化对象(Serializing),相反的处理过程称为反序列化。

序列化有三种主要的用途:

A、作为一种持久化格式化:一个对象被序列化以后,它的编码可以被储存到磁盘上,供以后反序列化使用。

B、作为一种通信数据格式:序列化结果可以从一个正在运行的虚拟机,通过网络被传递到另外一个虚拟机上。

C、作为一种拷贝、克隆机制:将对象序列化到内存的缓存区中,然后通过反序列化,可以得到一个已存对象进行深拷贝的新对象。

在分布式数据处理中,主要使用上面提到的前两种功能:数据持久化和通信数据化格式。在分析Hadoop的序列化机制前,先介绍一下Java內建的序列化机制。

 

1.1 Java內建序列化机制

Java序列化机制将对象转换为连续的byte数据,这些数据可以在日后还原为原先的对象状态,该机制还能自动处理不同操作系统的差异,在windows上序列化的Java对象,可以在Unix系统上被重建出来,不需要担心不同机器上的数据表示方法,也不需要担心字节排列次序,如大端、小端或者其他细节。

Java中,让一个类的实例可被序列化非常简单,只需在类声明中加入implements序列化即可。Serializable接口是一个标志,不具备任何成员函数,其定义如下:

public interface Serializable{}

 

1.2 Hadoop序列化机制

Java序列化机制不同,Hadoop的序列化机制通过调用对象的write()方法,将对象序列化到流中,反序列化的过程也类似,通过对象的readFields()方法,从流中读取数据。值得一提的是,Java序列化机制中,反序列化过程中会不断地创建新的对象,但在Hadoop的序列化机制的反序列化机制中,用户可以复用对象。

 

1.3 Hadoop序列化机制的特征

对于处理大数据的Hadoop平台,其序列化机制需要具有如下特征:

A、紧凑:由于带宽是Hadoop集群中最稀缺的资源,一个紧凑的序列化机制可以充分利用数据中心的带宽。

B、快速:在进程间通信(包括MapReduce过程涉及的数据交互)时会大量使用序列化机制,因此,必须尽量减少序列化和反序列化的开销。

C、可扩展:随着系统的发展,系统间通信的协议会升级。类的定义会发生变化,序列化机制需要支持这些升级和变化。

D、互操作:可以支持不同开发语言的通信,如C++和Java间的通信。这样的通信可以通过文件(需要精心设计文件的格式)或者后面介绍的IPC机制实现。

 

1.4 Hadoop Writable机制

为了支持1.3描述的特性,Hadoop引入了org.apache.hadoop.io.Writable接口,作为所有可序列化对象必须支持的接口。Writable机制紧凑、快速,该接口不是标志性接口,它包含了两个方法:

ublic interface Writable {
  /**
   * 输出(序列化)对象到流中
   *
   * @param out 序列化的结果保存到流中
   * @throws IOException
   */
  void write(DataOutput out) throws IOException;
 
  /**
   * 从流中读取(反序列化)对象
   *
   *
   * 为了效率,请尽可能复用现有的对象
   *
   * @param in 从该流中读取数据
   * @throws IOException
   */
  void readFields(DataInput in) throws IOException;
}

 

Hadoop序列化机制中还包括几个重要接口:WritableComparable、RawComparator、和WritableComparator。

WritableComparable,顾名思义,它提供类型比较的能力,这对MapReduce至关重要。该接口继承自Writable接口和Comparable接口。其中Comparable接口用于类型进行比较。

RawComparator接口具有高效比较能力。该接口允许执行者比较流中读取未被反序列化为对象的记录,从而省去了创建对象的所有开销。

WritableComparator是WritableComparable和RawComparator的一个通用实现,先调用RawComparator的compare()方法。然后调用对象的compare()方法。

1.5 典型的Writable类详解

Hadoop将很多Writable类归入了org.apache.hadoop.io包。本节主要讲解Java基本类和ObjectWritable的实现。

1.5.1  Java基本类型的Writable封装

目前Java基本类型对应的Writable封装见下表,所有这些Writable类都继承自WritableComparable,也就是说他们是可以比较的,同时,它们都有get与set方法,用于获得和设置封装的值。

Java基本类型

Writable

序列化后的长度

布尔型

BooleanWritable

1

字节型

ByteWritable

1

整型

IntWritable

VIntWritable

4

1-5

浮点型

FloatWritable

4

长整型

LongWritable

VLongWritable

8

1-9

双精度浮点型

DoubleWritable

8

1.5.2  ObjectWritable类封装

针对Java基本类型、字符串、枚举、Writable、空值、Writable的其他子类,ObjectWritable提供了一个封装,适用于字段需要使用多种类型。

该类有三个成员变量,包括被封装的对象实例instance、该对象运行时类的Class对象和Configuration对象。

 

1.6 Hadoop序列化框架

大部分的Mapreduce程序都是用Writable键-值作为输入输出,但这并不是HadoopAPI指定的,其他序列化机制也能和Hadoop配合,并应用于MapReduce中。

目前除了前面介绍的Java序列化机制和Hadoop的Writable机制,还流行其他序列化框架。列表如下:

A、Avro:是一个数据序列化系统,用于支持大批量数据交换的应用。它的主要特点有:支持二进制序列化方式,可以便捷、快速地处理大量数据,动态语言友好,AVRO提供的机制使动态语言可以方便处理avro数据。

B、Thrift:是一个可伸缩、跨语言的服务开发框架,由FaceBook贡献给开源社区,是Facebook的核心框架之一。

C、Google Protocol Buffer是Google内部的混合语言数据标准,提供了一种轻便高效的结构化数据存储格式。

 

2 压缩

一般说来,计算机处理的数据都存在一些冗余度,同时数据中间,尤其是相邻数据间存在着相关性,所以可以通过一些有别于原始编码的特殊编码方式来保存数据,使数据占用的存储空间比较小,这个过程一般叫压缩。和压缩对应的概念是解压缩,就是将被压缩的数据从特殊编码方式还原为原始数据的过程。

压缩广泛应用于海量数据处理中,对数据文件进行压缩,可以有效减少存储文件所需的空间,并加快数据在网络上或者磁盘上的传输速度。在Hadoop中,压缩应用于文件存储,Map阶段和Reduce阶段的数据交换等情景。

2.1 Hadoop压缩简介

Hadoop作为一个较通用的海量数据处理平台,在使用压缩方式方面,主要考虑压缩速度和压缩文件的可分割性。

所有的压缩算法都会考虑时间和空间的权衡,更快的压缩和解压缩速度通常会耗费更多的空间。

当使用MapReduce处理压缩文件时,需要考虑压缩文件的可分割性。考虑我们需要对保持在HDFS上的一个大小为1GB的文本文件进行处理,当前HDFS的数据块大小为64MB的情况下,该文件被存储为16块,对应的MapReduce作业将会将该文件分为16个输入分片,提供给16个独立的Map任务进行处理。

但如果该文件是一个gzip格式的压缩文件,这时,MapReduce作业不能够将该文件分为16个分片,因为不可能从gzip数据流中的某个点开始,进行数据解压。

但如果该文件是一个bzip2格式的压缩文件,那么,MapReduce作业可以通过bzip2格式压缩文件中的块,将输入划分为若干输入分片,并从块开始处于开始解压缩数据。bzip2格式压缩文件中,块与块之间提供了一个48位的同步标记,因此bzip2支持数据分割。

压缩格式

UNIX工具

算法

文件扩展名

支持多文件

可分割

deflate

DEFLATE

.deflate

gzip

gzip

DEFLATE

.gz

zip

zip

DEFLATE

.zip

bzip

bzip2

bzip2

.bz2

LZO

lzop

LZO

.lzo

为了支持多种压缩解压缩算法,Hadoop引入了编码/解码器。与Hadoop序列化框架类似,编码/解码器也是使用抽象工厂的设计模式。目前,Hadoop支持的编码/解码器如下表所示:

压缩格式

对应的编码/解码器

DEFLATE

org.apache.hadoop.io.compress.DeflateCodec

gzip

org.apache.hadoop.io.compress.GzipCodec

Bzip

org.apache.hadoop.io.compress.BZip2Codec

Snappy

org.apache.hadoop.io.compress.SnappyCodec

同一个压缩方法对应的压缩、解压缩相关工具,都可以通过相应的编码解码器获得。

 

2.2 Hadoop压缩框架

   2.2.1  编码/解码器

CompressionCodec接口实现了编码/解码器,使用的是抽象工厂的设计模式,该接口提供了一系列方法,用于创建特定压缩算法的相关设施。

该接口中的方法很对称,一个压缩功能总对应着一个解压缩功能,其中与压缩有关的方法包括:

A、createOutputStream()用于通过底层输出流创建对应压缩算法的压缩流,重载的createOutputStream()方法可使用压缩器创建压缩流。

B、createCompressor()用于创建压缩算法对应的压缩器。

该接口中还提供了获取对应文件扩展名的方法getDafaultExtension(),该方法返回扩展名的字符串。

CompressionCodecFactory是Hadoop压缩框架的另一个类,它应用了工厂方法,使用者可以通过它提供的方法获得CompressionCodec。

 

2.2.2  压缩器/解压器

Compressor可以插入压缩输出流的实现中,提供具体的压缩功能。该类通过setInput()方法接收数据到内部缓冲区,自然可以多次调用setInput()方法,但是内部缓冲区总是会被写满。可以通过needInput()的返回值,如果是false,表明缓冲区已经满了,这时必须通过compress()方法获取压缩后的数据,释放缓冲区空间。

为了提高压缩效率,并不是每次用户调用setInout()方法,压缩器就会立即工作,所以为了通知压缩器所有数据已经写入,必须使用finish()方法。finish()调用结束后,压缩器缓冲区中保持的已经压缩的数据,可以继续通过compress()方法获得。至于要判断压缩器是否还有未读取的压缩数据,则需要利用finished()方法来判断。

inbuf分成几部分,通过setInput()方法送入压缩器,而在finish()调用结束后,通过finished()循序怕段压缩器是否还有未读取得数据,并使用compress()方法获取数据。

end()方法用于关闭解压缩器并放弃所有未处理的输入;

reset()方法用于重置压缩器,以处理新的输入数据集合;

reinit()方法更进一步允许使用Hadoop的配置系统,重置并重新配置压缩器。

Decompressor提供具体的解压功能并插入CompressionInputStream中。

 

2.2.3  压缩流/解压缩流

CompressionOutputStream:该类继承OutputStream,也是个抽象类,该类实现了close()和flush()方法,但用于输出数据的write()方法、用于结束压缩过程并输入写到底层流的finish()方法和重置压缩状态的resetState()方法还是抽象方法,需要该类的子类去实现。

CompressorStream使用压

本文出自 “王威” 博客,请务必保留此出处http://jaydenwang.blog.51cto.com/6033165/1839616

Hadoop序列化与压缩

标签:计算机系统   java   虚拟机   网络   通信   

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