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MI & CI

时间:2014-09-01 12:11:43      阅读:213      评论:0      收藏:0      [点我收藏+]

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目前,很多特征选择文献主要是依据对共信息的直观认识使用它,即:正值表示表型的存在使特征间依赖程度增加,是特征间存在相互作用的证据;负值表示表型的存在使特征间冗余性增加;零表示特征是相互独立的,或者说,是特征间的增益与冗余相互抵消了。因此,从理论上深入认识共信息是一项创新工作。

 

识别阶段的第一项工作是使用共信息测度穷举搜索候选 SNP 集合中的 SNP 交互作用。当 SNP 组合中所有 SNP 与表型的共信息为正时,说明表型使 SNP 间的依赖程度增加了,是 SNP 组合与表型间存在相互作用的证据。因此,将该 SNP 组合保留并进一步使用置换检验测度评价。当 SNP 组合中所有 SNP 与表型的共信息为非正时,说明 SNP 组合与表型间存在着冗余关系。因此,将该 SNP 组合过滤,后面不再考虑。

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一个 SNP 对表型的总效应,不仅包括其单独作用对表型的效应 (主效应) ,还包括该 SNP 通过与其它 SNP 共同作用影响表型效应中的自身部分(边际效应)

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原文地址:http://www.cnblogs.com/Acceptyly/p/3948741.html

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