标签：建立 返回 速度 不用 自己的 ted sci 价格 验证
mkdir -p example_PE250 cd example_PE250
mkdir -p temp result
PE250_1_fastqc.html # 网页评估报告PE250_1_fastqc.zip # 网页报告相关文本和图片压缩包
# 先激活工作环境 source activate qiime1 # 关闭工作环境：不用时关闭，不然你其它程序可能会出错 source deactivate # 验证实验设计是否有错误 validate_mapping_file.py -m mappingfile.txt
mappingfile_corrected.txt # 自动修正的实验设计，小错误会自动修改，但末必符合你的要求，不建议直接使用mappingfile.html # 结果的错误报告，可下载查看网页，会高亮显示错误的位置mappingfile.log # 运行结果报告
# 双端序列合并 join_paired_ends.py -f PE250_1.fq.gz -r PE250_2.fq.gz -m fastq-join -o temp/PE250_join
fastqjoin.join.fastq # 合并成功的序列fastqjoin.un1.fastq # 左端未合并成功的序列fastqjoin.un2.fastq # 右端未合并成功的序列
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原文地址：http://www.cnblogs.com/freescience/p/7399783.html
