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共线性synteny

时间:2017-08-31 23:07:50      阅读:183      评论:0      收藏:0      [点我收藏+]

标签:col   定位   基因组   而在   oci   高达   类型   line   检测   

  植物基因组在染色体大小和数目上差异很大,在一些十字花科植物如拟南芥,只不过100 Mb差异,而在百合属中竟高达100000 Mb。但是基因的数目和类型并没有这样明显的差别。不同植物基因组之间大小差异是由于基因组内存在重复DNA的缘故(多倍性这是一种原因)。在植物进化过 程中,基因组大小变化是一种相对频繁的事件,但这些变化并不与基因多少及顺序变化相关联。基因数量及顺序的保守性称为同线性(colinearity), 近来文献中越来越多地用共线性(synteny)来描述同线性(colinearity)和同源性(homeology)。共线性或同线性是一种令个惊奇 的现象,拟南芥(双子叶植物)和水稻(单子叶植物)是由2亿年前的共同祖先分枝进化而来的,但两个物种仍可检测到尽管比较低的共线性。当不同禾本科植物基 因组进行对齐和比较时,这种共线性就更加明显而有用。比如在玉米中鉴定到的重要农艺性状如颗粒重、抗虫性等性状,也与水稻的基因组序列相关。这使得鉴定这 些性状的基因变得容易。因为水稻基因组草图已经完成,许多数量性状位点(quantitative-trait loci,QTLs)也已经定位在水稻基因组图谱上。

共线性synteny

标签:col   定位   基因组   而在   oci   高达   类型   line   检测   

原文地址:http://www.cnblogs.com/shengxinjack/p/7460739.html

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