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机器学习实战笔记-决策树

时间:2017-11-08 00:45:36      阅读:238      评论:0      收藏:0      [点我收藏+]

标签:结果   方法   blog   原理   注意   sts   ==   features   属性   

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图3-1所示的流程图就是一个决策树,正方形代表判断模块(decisionblock),椭圆形代表终止模块(terminating block),表示已经得出结论,可以终止运行。从判断模块引出的左右箭头称作分支(branch),它可以到达另一个判断模块或者终止模块。
图3-1构造了一个假想的邮件分类系统,它首先检测发送邮件域名地址。如果地址为myEmpIoyer.com,则将其放在分类“无聊时需要阅读的邮件”中。如果邮件不是来自这个域名,则检查邮件内容里是否包含单词曲棍球,如果包含则将邮件归类到“需要及时处理的朋友邮件” ,如果不包含则将邮件归类到“无需阅读的垃圾邮件”。

K-近邻算法可以完成很多分类任务,但是它最大的缺点就是无法给出数据的内在含义,决策树的主要优势就在于数据形式非常容易理解。

1 决策树的构造
决策树
优点:计算复杂度不高,输出结果易于理解,对中间值的缺失不敏感,可以处理不相关特征数据。
缺点:可能会产生过度匹配问题。
适用数据类型:数值型和标称型。

主要思路:
在构造决策树时,我们需要解决的第一个问题就是,当前数据集上哪个特征在划分数据分类时起决定性作用。为了找到决定性的特征,划分出最好的结果,我们必须评估每个特征。完成测试之后,原始数据集就被划分为几个数据子集。这些数据子集会分布在第一个决策点的所有分支上。如果某个分支下的数据属于同一类型,则当前无需阅读的垃圾邮件已经正确地划分数据分类,无需进一步对数据集进行分割。如果数据子集内的数据不属于同一类型,则需要重复划分数据子集的过程。如何划分数据子集的算法和划分原始数据集的方法相同,直到所有具有相同类型的数据均在一个数据子集内。

创建分支的伪代码函数createBranch()如下所示::
检测数据集中的每个子项是否属于同一分类:
If so return 类标签;
Else
寻找划分数据集的最好特征
划分数据集 ‘
创建分支节点
for每个划分的子集
调用函数createBranch并增加返回结果到分支节点中
return分支节点

决策树的一般流程
(1)收集数据:可以使用任何方法。
(2)准备数据:树构造算法只适用于标称型数据,因此数值型数据必须离散化。
(3)分析数据:可以使用任何方法,构造树完成之后,我们应该检查图形是否符合预期。
(4)训练算法:构造树的数据结构。
(5)测试算法:使用经验树计算错误率。
(6)使用算法:此步骤可以适用于任何监督学习算法,而使用决策树可以更好地理解数据
的内在含义。

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表3-1的数据包含5个海洋动物,特征包括:不浮出水面是否可以生存,以及是否有脚蹼。我们可以将这些动物分成两类:鱼类和非鱼类。现在我们想要决定依据第一个特征还是第二个特征划分数据。在回答这个问题之前,我们必须采用量化的方法判断如何划分数据。

1.1信息増益
划分数据集的大原则是:将无序的数据变得更加有序。我们可以使用多种方法划分数据集,但是每种方法都有各自的优缺点。组织杂乱无章数据的一种方法就是使用信息论度量信息,信息论是量化处理信息的分支科学。我们可以在划分数据之前使用信息论量化度量信息的内容。在划分数据集之前之后信息发生的变化称为信息增益,知道如何计算信息增益,我们就可以计算每个特征值划分数据集获得的信息增益,获得信息增益最高的特征就是最好的选择。在可以评测哪种数据划分方式是最好的数据划分之前,我们必须学习如何计算信息增益。集合信息的度量方式称为香农熵或者简称为熵,这个名字来源于信息论之父克劳德?香农。
熵定义为信息的期望值,在明晰这个概念之前,我们必须知道信息的定义。如果待分类的事务可能划分在多个分类之中’ 则符号xi的信息定义为
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其中p(xi)是选择该分类的概率。
为了计算熵,我们需要计算所有类别所有可能值包含的信息期望值,通过下面的公式得到:
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其中n是分类的数目。

计算给定数据集的香农熵
代码:

from math import log 
def calcShannonEnt(dataSet):
labelCounts = {}
for featVec in dataSet:
currentLabel = featVec[-1]
labelCounts[currentLabel] = labelCounts.get(currentLabel,0) + 1
shannonEnt = 0.0
for key in labelCounts:
prob = float(labelCounts[key])/numEntries
shannonEnt -= prob * log(prob,2)
return shannonEnt

创建数据集
代码:

def createDataSet(): 
dataSet = [[1,1,‘yes‘],[1,1,‘yes‘],[1,0,‘no‘],[0,1,‘no‘],[0,1,‘no‘]]
labels = [‘no surfacing‘,‘flippers‘]
return dataSet,labels

测试截图:
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如果我们将数据集中的第一行数据的分类改为’maybe’,测试截图如下:
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我们发现,数据集的分类越分散,那么熵越大。得到熵之后,我们就可以按照获取最大信息增益的方法划分数据集

1.2划分数据集
分类算法除了需要测量信息熵,还需要划分数据集,度量花费数据集的熵,以便判断当前是否正确地划分了数据集。我们将对每个特征划分数据集的结果计算一次信息熵,然后判断按照哪个特征划分数据集是最好的划分方式

按照给定特征划分数据集,代码如下

def splitDataSet(dataSet, axis, value):
    retDataSet = []
    for featVec in dataSet:
        if(featVec[axis] == value):
            reducedFeatVec = featVec[:axis]
            reducedFeatVec.extend(featVec[axis+1:])
            retDataSet.append(reducedFeatVec)
    return retDataSet

测试截图如下:
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接下来我们将遍历整个数据集,循环计算香农熵和splitDataSet()函数,找到最好的特征划分方式。熵计算将会告诉我们如何划分数据集是最好的数据组织方式。
代码:

def chooseBestFeatureToSplit(dataSet):
    numFeatures = len(dataSet[0]) - 1
    baseEntropy = calcShannonEnt(dataSet)
    bestInfoGain = 0.0;bestFeature = -1
    for i in range(numFeatures):
        featList = [example[i] for example in dataSet]
        uniqueVals = set(featList)
        newEntropy = 0.0
        for value in uniqueVals:
            subDataSet = splitDataSet(dataSet,i,value)
            prob = len(subDataSet)/float(len(dataSet))
            newEntropy += prob * calcShannonEnt(subDataSet)
        infoGain = baseEntropy - newEntropy
        if(infoGain > bestInfoGain):
            bestInfoGain = infoGain
            bestFeature = i
    return bestFeature

测试截图:
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1.3递归构建决策树
工作原理:
得到原始数据集,然后基于最好的属性值划分数据集,由于特征值可能多于两个,因此可能存在大于两个分支的数据集划分。第一次划分之后,数据将被向下传递到树分支的下一个节点,在这个节点上,我们可以再次划分数据。因此我们可以采用递归的原则处理数据集。
递归结束的条件是:程序遍历完所有划分数据集的属性,或者每个分支下的所有实例都具有相同的分类。如果所有实例具有相同的分类,则得到一个叶子节点或者终止块。任何到达叶子节点的数据必然属于叶子节点的分类。
如果数据集已经处理了所有属性,但是类标签依然不是唯一的,此时我们需要决定如何定义该叶子节点,在这种情况下,我们通常会采用多数表决的方法决定该叶子节点的分类。

多数表决代码:

def majorityCnt(classList): 
classCount = {}
for vote in classList:
classCount[vote] = classCount.get(vote,0) +1
sortedClassCount = sorted(classCount.items(), key=operator.itemgetter(1), reverse=True)
return sortedClassCount[0][0]
测试截图:
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创建数的函数代码:

def c r e a teTree(dataSet,labels): 
classList = [example[-1] for example in dataSet]
if classList.count (classList[0]) == len(classList):
return classList[0]
if len{dataSet[0]) == 1:
return majorityCnt (classList)
bestFeat = chooseBestFeatureToSplit{dataSet)
bestFeatLabel = labels[bestFeat]
myTree = {bestFeatLabel:{}}
del{labels[bestFeat])
featValues = [example[bestFeat] for example in dataSet]
uniqueVals = set{featValues)
for value in uniqueVals:
subLabels = labels[:]#保证在递归的不同调用层级中的labels互不影响
myTree[bestFeatLabel][value] = createTree(splitDataSet(dataSet, bestFeat, value) ,subLabels)
return myTree

测试截图:
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需要注意的是,subLabels = labels[:],这行代码复制了类标签,并将其存储在新列表变量sublabels中。之所以这样做,是因为在python中函数参数是列表类型时,参数是按照引用方式传递的。为了保证每次调用函数createTree()不改变原始列表的内容,使用新变量subLabels代替原始列表。

2.在Python中使用Matplotlib注解绘制树形图
2.1Matplotlib注解
Matplotlib提供了一个注解工具annotations,非常有用,它可以在数据图形上添加文本注
释。注解通常用于解释数据的内容。由于数据上面直接存在文本描述非常丑陋,因此工具内嵌支
持带箭头的划线工具,使得我们可以在其他恰当的地方指向数据位置,并在此处添加描述信息,
解释数据内容。

使用文本注解绘制树节点
代码:

import matplotlib.pyplot as plt 
decisionNode = dict(boxstyle=”sawtooth”, fc=”0.8”)
leafNode = dict(boxstyle=”round4”, fc=”0.8”)
arrow_args = dict(arrowstyle=”<-“)
def plotNode(nodeTxt, centerPt, parentPt, nodeType):
createPlot.ax1.annotate(nodeTxt, xy=parentPt,xycoords=’axes fraction’, xytext=centerPt, textcoords=’axes fraction’, va=”center”, ha=”center”, bbox=nodeType, arrowprops=arrow_args)
def createPlot():
fig = plt.figure(1,facecolor=”white”)
fig.clf()
createPlot.ax1=plt.subplot(111, frameon=False)
plotNode(‘a decision node’, (0.5, 0.1), (0.1, 0.5), decisionNode)
plotNode(‘a leaf node’, (0.8, 0.1), (0.3, 0.8), leafNode)
plt.show()
测试截图:
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2.2构造注解树
绘制一棵完整的树需要一些技巧。我们虽然有x、y坐标,但是如何放置所有的树节点却是个问题。我们必须知道有多少个叶节点,以便可以正确确x轴的长度;我们还需要知道树有多少层,以便可以正确确定y轴的高度。这里我们定义两个新函数getNurnLeafs()和getTreeDepth( ),来获取叶节点的数目和树的层数
获取叶节点的数目和树的层数:
代码:

def getNumLeafs(myTree): 
numLeafs = 0
firstStr = list(myTree.keys())[0]
secondDict = myTree[firstStr]
for key in secondDict.keys():
if type(secondDict[key]).name==‘dict‘:
numLeafs += getNumLeafs(secondDict[key])
else:
numLeafs += 1
return numLeafs
def getTreeDepth(myTree):
maxDepth = 0
firstStr = list(myTree.keys())[0]
secondDict = myTree[firstStr]
for key in secondDict.keys():
if type(secondDict[key]).name==‘dict‘:
thisDepth = 1 + getTreeDepth(secondDict[key])
else:
thisDepth = 1
if thisDepth > maxDepth:
maxDepth = thisDepth
return maxDepth

测试截图:
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绘制树的函数代码:
def plotMidText(cntrPt, parentPt, txtString): 
xMid = (parentPt[0] - cntrPt[0])/2.0 + cntrPt[0]
yMid = (parentPt[1] - cntrPt[1])/2.0 + cntrPt[1]
createPlot.ax1.text(xMid, yMid, txtString)
#绘制树的主要方法
def plotTree(myTree, parentPt, nodeTxt):
numLeafs = getNumLeafs(myTree)
depth = getTreeDepth(myTree)
firstStr = list(myTree.keys())[0]
cntrPt = (plotTree.xOff + (1.0 + float(numLeafs))/2.0/plotTree.totalW,plotTree.yOff)
plotNode(firstStr, cntrPt, parentPt, decisionNode)
secondDict = myTree[firstStr]
plotTree.yOff = plotTree.yOff - 1.0/plotTree.totalD
for key in secondDict.keys():
if type(secondDict[key]).name==’dict’:
plotTree(secondDict[key],cntrPt,str(key))
else:
plotTree.xOff = plotTree.xOff + 1.0/plotTree.totalW
plotNode(secondDict[key], (plotTree.xOff, plotTree.yOff), cntrPt, leafNode)
plotMidText((plotTree.xOff, plotTree.yOff), cntrPt, str(key))
plotTree.yOff = plotTree.yOff + 1.0/plotTree.totalD
def createPlot(inTree):
fig = plt.figure(1,facecolor=”white”)
fig.clf()
axprops = dict(xticks=[],yticks=[])
createPlot.ax1 = plt.subplot(111,frameon=False, **axprops)
plotTree.totalW =float(getNumLeafs(inTree))
plotTree.totalD = float(getTreeDepth(inTree))
plotTree.xOff = -0.5/plotTree.totalW; plotTree.yOff = 1.0;
plotTree(inTree, (0.5,1.0), ”)
plt.show()
效果截图:
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3.测试和存储分类器
3.1测试算法:使用决策树执行分类
使用决策树的分类函数代码:

 
def classify(inputTree, featLabels, testVec):
firstStr = list(inputTree.keys())[0]
secondDict = inputTree[firstStr]
featIndex = featLabels.index(firstStr)
for key in secondDict.keys():
if testVec[featIndex] == key:
if type(secondDict[key]).name==‘dict‘:
classLabel = classify(secondDict[key],featLabels,testVec)
else:
classLabel = secondDict[key]
return classLabel

测试截图:
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3.2使用算法:决策树的存储
构造决策树是很耗时的任务,即使处理很小的数据集,如前面的样本数据,也要花费几秒的
时间,如果数据集很大,将会耗费很多计算时间。然而用创建好的决策树解决分类问题,贝何以
很快完成。因此,为了节省计算时间,最好能够在每次执行分类时调用巳经构造好的决策树。为
了解决这个问题,需要使用python模块pickle序列化对象,。序列化对象可以在磁
盘上保存对象,并在需要的时候读取出来。任何对象都可以执行序列化操作,字典对象也不例外

3.3使用pickle模块存储决策树
代码:

def storeTree(inputTree,filename):
    import pickle
    fw = open(filename,‘wb+‘)
    pickle.dump(inputTree,fw)
    fw.close()
def grabTree(filename):
    import pickle
    fr = open(filename,‘rb+‘)
    return pickle.load(fr)

测试截图:
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3.4示例:使用决策树预测隐形眼镜类型
(1 )收集数据:提供的文本文件。
(2 )准备数据:解析tab键分隔的数据行。
(3 )分析数据:快速检查数据,确保正确地解析数据内容,使用createPlot()函数绘制最终的树形图。
(4)训练算法:使用3.1节的createTree()函数。
(5)测试算法:编写测试函数验证决策树可以正确分类给定的数据实例。
(6)使用算法:存储树的数据结构,以便下次使用时无需重新构造树。
代码及测试截图:
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