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What Ensembl genome version should I use for alignments? (e.g. toplevel.fa vs. primary_assembly.fa) | 用哪个版本的Ensembl的基因组

时间:2018-03-25 20:47:49      阅读:549      评论:0      收藏:0      [点我收藏+]

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这是一个很细节也很实际的问题,到底用哪个版本?

参考:

What Ensembl genome version should I use for alignments? (e.g. toplevel.fa vs. primary_assembly.fa)

 

大部分都推荐使用soft-mask版本的,也就是没有把repeat替换为N。

 

What Ensembl genome version should I use for alignments? (e.g. toplevel.fa vs. primary_assembly.fa) | 用哪个版本的Ensembl的基因组

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原文地址:https://www.cnblogs.com/leezx/p/8646225.html

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