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Hdu 2457 DNA repair (ac自动机+dp)

时间:2014-10-01 19:51:21      阅读:159      评论:0      收藏:0      [点我收藏+]

标签:blog   io   os   ar   for   sp   2014   c   on   

题目大意:

修改文本串的上的字符,使之不出现上面出现的串。问最少修改多少个。


思路分析:

dp[i][j]表示现在 i 个字符改变成了字典树上的 j 节点。

然后顺着自动机一直转移方程。

注意合法与不合法。


#include <cstdio>
#include <iostream>
#include <cstring>
#include <algorithm>
#define inf 0x3f3f3f3f
using namespace std;

const char tab = 0;
const int max_next = 4;
int idx;
struct trie
{
    struct trie *fail;
    struct trie *next[max_next];
    int isword;
    int index;
    trie()
    {
        isword=0;
        memset(next,NULL,sizeof next);
        fail=NULL;
    }
};
int rev[256];
trie *que[100005],ac[100005];
int head,tail;

trie *New()
{
    trie *temp=&ac[idx];
    for(int i=0;i<4;i++)temp->next[i]=NULL;
    temp->fail=NULL;
    temp->isword=0;
    temp->index=idx++;
    return temp;
}
void Insert(trie *root,char *word,int len){
    trie *t=root;
    for(int i=0;i<len;i++){
        if(t->next[rev[word[i]]]==NULL)
            t->next[rev[word[i]]]=New();
        t=t->next[rev[word[i]]];
    }
    t->isword++;
}

void acbuild(trie *root){
    int head=0,tail=0;
    que[tail++]=root;
    root->fail=NULL;
    while(head<tail){
        trie *temp=que[head++],*p;
        for(int i=0;i<max_next;i++){
             if(temp->next[i]){
                if(temp==root)temp->next[i]->fail=root;
                else {
                    p=temp->fail;
                    while(p!=NULL){
                        if(p->next[i]){
                            temp->next[i]->fail=p->next[i];
                            break;
                        }
                        p=p->fail;
                    }
                    if(p==NULL)temp->next[i]->fail=root;
                }
                if(temp->next[i]->fail->isword)temp->next[i]->isword++;
                que[tail++]=temp->next[i];
             }
             else if(temp==root)temp->next[i]=root;
             else temp->next[i]=temp->fail->next[i];
        }
    }
}

void del(trie *root)
{
    for(int i=0;i<max_next;i++)
    if(root->next[i])del(root->next[i]);
    free(root);
}

int dp[2005][2005];
int solve(char *word,int len)
{
    memset(dp,0x3f,sizeof dp);
    dp[0][0]=0;
    for(int i=1;i<=len;i++)
    {
        for(int j=0;j<idx;j++)
        {
            if(ac[j].isword)continue;
            if(dp[i-1][j]==inf)continue;
            for(int k=0;k<4;k++)
            {
                int p=ac[j].next[k]->index;
                if(ac[p].isword)continue;
                dp[i][p]=min(dp[i][p],dp[i-1][j]+(k!=rev[word[i-1]]));
            }
        }
    }
    int ans=inf;
    for(int i=0;i<idx;i++)
        ans=min(ans,dp[len][i]);
    return ans==inf?-1:ans;
}
char word[10005];
int main()
{
    rev['A']=0;
    rev['G']=1;
    rev['C']=2;
    rev['T']=3;

    int n,cas=1;
    while(scanf("%d",&n)!=EOF && n)
    {
        idx=0;
        trie *root=New();
        for(int i=1;i<=n;i++)
        {
            scanf("%s",word);
            Insert(root,word,strlen(word));
        }
        acbuild(root);  
        scanf("%s",word);
        printf("Case %d: %d\n",cas++,solve(word,strlen(word)));
    }
    return 0;
}


Hdu 2457 DNA repair (ac自动机+dp)

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原文地址:http://blog.csdn.net/u010709592/article/details/39719123

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