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【awk】用awk将Fasta文件序列变成一行

时间:2018-09-12 11:16:15      阅读:537      评论:0      收藏:0      [点我收藏+]

标签:print   class   color   bsp   fas   sed   fast   you   int   

awk:
awk /^>/&&NR>1{print "";}{ printf "%s",/^>/ ? $0" ":$0 } YourFile

sed:
sed -n 1{x;d;x};${H;x;s/\n/ /1;s/\n//g;p;b};/^>/{x;s/\n/ /1;s/\n//g;p;b};H YourFile

 

【awk】用awk将Fasta文件序列变成一行

标签:print   class   color   bsp   fas   sed   fast   you   int   

原文地址:https://www.cnblogs.com/muuyouzhi/p/9633185.html

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