二代测序技术总结

公司

平台名称

测序方法

检测方法

读长（bp）

优点

相对局限性

罗氏/454

基因组测序仪FLX系统

焦磷酸测序法

光学

230-400

二代测序中读长最长；比一代测序通量要大

样品制备较难；难于处理重复和同种碱基多聚区域；试剂冲洗带来错误累积；仪器昂贵；

Illumina

HiSeq2000(4000)/Miseq

SBS

荧光/光学

2x(150-300)

很高测序通量；

仪器昂贵；用于书记胡删节和分析的费用很高

ABL/SOLiD

5500x|SOLID系统

连接测序法

荧光/光学

25-35

高通量测序，二代测序平台中，拼接人类基因组的试剂成本最低

测序运行时间长；读长短，造成成本高，数据分析、拼接困难；仪器昂贵

Life Technology

PGM/Proton

SBS

以离子敏感场效应晶体管验测PH值变化

100-200

对核酸碱基的参入可直接测定；在自然条件下进行DNA合成(不需使用修饰过的碱基)

一步步洗脱过程导致错误累积；阅读高重复和同种多聚序列时有潜在困难

Complete Genomics

Blackbird

cPAL

荧光/光学

100

通量高；成本低；单测序步骤独立，使错误累积最低

低读长；模板制备妨碍长重复序列区域测序；样品制备费事