spark的bulkload报错及解决

时间：2019-03-26 22:30:17 阅读：379 评论：0 收藏：0 [点我收藏+]

标签：lap fail aging xxx cto obj xtend add amp

技术图片

需求

将HDFS上的数据解析出来，然后通过hfile方式批量写入Hbase（需要多列写入）

写入数据的关键api：

rdd.saveAsNewAPIHadoopFile(
        stagingFolder,
        classOf[ImmutableBytesWritable],
        classOf[KeyValue],
        classOf[HFileOutputFormat2],
        job.getConfiguration)

特殊地方：

1）：

最初写hfile警告??：

Does it contain files in subdirectories that correspond to column family names

这个原因大概3种：

A：代码问题

B：数据源问题

C：setMapOutputKeyClass 和 saveAsNewAPIHadoopFile中的Class不一致

（我的是数据源问题）

2）：

正常些put操作的时候，服务端自动帮助排序，因此在使用put操作的时候没有涉及到这样的错误：

Added a key not lexically larger than previous

但是在写hfile的时候如果出现报错：

Added a key not lexically larger than previous

这样的错误，一般会认为rowkey没有做好排序，然后傻fufu的去验证了一下，rowkey的确做了排序

真正原因：

spark写hfile时候是按照rowkey+列族+列名进行排序的，因此在写入数据的时候，要做到整体有序

（事情还没完）

3）：

因为需要多列写入，最好的方式：要么反射来动态获取列名称和列值、要么通过datafame去获取（df.columns）

反射方式：

val listData: RDD[(ImmutableBytesWritable, ListBuffer[KeyValue])] = rdd.map {
        line =>
          val rowkey = line.vintime
          val clazz = Class.forName(XXXXXXXXXXXXXXXX)
          val fields = clazz.getDeclaredFields
          var list = new ListBuffer[String]()
          var kvlist = new ListBuffer[KeyValue]()//
          if (fields != null && fields.size > 0) {
            for (field <- fields) {
              field.setAccessible(true)
              val column = field.getName
              list.append(column)
            }
          }

          val newList = list.sortWith(_ < _)
          val ik = new ImmutableBytesWritable(Bytes.toBytes(rowkey))
          for(column <- newList){
            val declaredField: Field = line.getClass.getDeclaredField(column)
            declaredField.setAccessible(true)
            val value = declaredField.get(line).toString
            val kv: KeyValue = new KeyValue(
              Bytes.toBytes(rowkey),
              Bytes.toBytes(columnFamily),
              Bytes.toBytes(column),
              Bytes.toBytes(value))
            kvlist.append(kv)
          }
          (ik, kvlist)
    }

datafame方式：

val tmpData: RDD[(ImmutableBytesWritable, util.LinkedList[KeyValue])] = df.rdd.map(
      line =>{
        val rowkey = line.getAs[String]("vintime")
        val ik = new ImmutableBytesWritable(Bytes.toBytes(rowkey))
        var linkedList = new util.LinkedList[KeyValue]()
        for (column <- columns) {
          val kv: KeyValue = new KeyValue(
            Bytes.toBytes(rowkey),
            Bytes.toBytes(columnFamily),
            Bytes.toBytes(column),
            Bytes.toBytes(line.getAs[String](column)))
          linkedList.add(kv)
        }
        (ik, linkedList)
      })

    val result: RDD[(ImmutableBytesWritable, KeyValue)] = tmpData.flatMapValues(
      s => {
        val values: Iterator[KeyValue] = JavaConverters.asScalaIteratorConverter(s.iterator()).asScala
        values
      }
    ).sortBy(x =>x._1 , true)

仔细观察可以发现，其实两者都做了排序操作，但是即便经过(1)步骤后仍然报错：

Added a key not lexically larger than previous

那么在回想一下之前写hfile的要求：

rowkey+列族+列都要有序，那么如果出现数据的重复，也不算是有序的操作！

因为，做一下数据的去重:

val key: RDD[(String, TransferTime)] = data.reduceByKey((x, y) => y)
val unitData: RDD[TransferTime] = key.map(line => line._2)

果然，这样解决了：Added a key not lexically larger than previous这个异常

但是会报如下另一个异常：

Kryo serialization failed: Buffer overflow

这个是因为在对一些类做kryo序列化时候，数据量的缓存大小超过了默认值，做一下调整即可

sparkConf.set("spark.kryoserializer.buffer.max" , "256m")
sparkConf.set("spark.kryoserializer.buffer" , "64m")

完整代码：

/**
  * Created by angel
  */
object WriteTransferTime extends WriteToHbase{
  /**
    * @param data      要插入的数据
    * @param tableName 表名
    **/
  override def bulkLoadData(data: RDD[Any], tableName: String , columnFamily:String): Unit = {

    val bean: RDD[TransferTime] = data.map(line => line.asInstanceOf[TransferTime])
    val map: RDD[(String, TransferTime)] = bean.map(line => (line.vintime , line))
    val key: RDD[(String, TransferTime)] = map.reduceByKey((x, y) => y)
    val map1: RDD[TransferTime] = key.map(line => line._2)
    val by1: RDD[TransferTime] = map1.sortBy(f => f.vintime)
    val listData: RDD[(ImmutableBytesWritable, ListBuffer[KeyValue])] = by1.map {
      line =>
        val rowkey = line.vintime
        val clazz = Class.forName("com.dongfeng.code.Bean.message.TransferTime")
        val fields = clazz.getDeclaredFields
        var list = new ListBuffer[String]()
        var kvlist = new ListBuffer[KeyValue]()//
        if (fields != null && fields.size > 0) {
          for (field <- fields) {
            field.setAccessible(true)
            val column = field.getName
            list.append(column)
          }
        }

        val newList = list.sortWith(_ < _)
        val ik = new ImmutableBytesWritable(Bytes.toBytes(rowkey))
        for(column <- newList){
          val declaredField: Field = line.getClass.getDeclaredField(column)
          declaredField.setAccessible(true)
          val value = declaredField.get(line).toString
          val kv: KeyValue = new KeyValue(
            Bytes.toBytes(rowkey),
            Bytes.toBytes(columnFamily),
            Bytes.toBytes(column),
            Bytes.toBytes(value))
          kvlist.append(kv)
        }
        (ik, kvlist)
    }
    val result: RDD[(ImmutableBytesWritable, KeyValue)] = listData.flatMapValues(
      s => {
        val values: Iterator[KeyValue] = s.iterator
        values
      }
    )
    val resultDD: RDD[(ImmutableBytesWritable, KeyValue)] = result.sortBy(x =>x._1 , true)
    WriteToHbaseDB.hfile_load(result , TableName.valueOf(tableName) , columnFamily)
    }
   }

WriteTransferTime

 def hfile_load(rdd:RDD[(ImmutableBytesWritable , KeyValue)] , tableName: TableName , columnFamily:String): Unit ={
    //声明表的信息
    var table: Table = null
    try{
      val startTime = System.currentTimeMillis()
      println(s"开始时间：-------->${startTime}")
      //生成的HFile的临时保存路径
      val stagingFolder = "hdfs://cdh1:9000/hfile/"+tableName+new Date().getTime//

      table = connection.getTable(tableName)
      //如果表不存在，则创建表
      if(!admin.tableExists(tableName)){
        createTable(tableName , columnFamily)
      }

      //开始导入
      val job = Job.getInstance(config)
      job.setJobName("DumpFile")
      job.setMapOutputKeyClass(classOf[ImmutableBytesWritable])
      job.setMapOutputValueClass(classOf[KeyValue])

      rdd.sortBy(x => x._1, true).saveAsNewAPIHadoopFile(
        stagingFolder,
        classOf[ImmutableBytesWritable],
        classOf[KeyValue],
        classOf[HFileOutputFormat2],
        job.getConfiguration)



      val load = new LoadIncrementalHFiles(config)
      val regionLocator = connection.getRegionLocator(tableName)
      HFileOutputFormat2.configureIncrementalLoad(job, table, regionLocator)
      load.doBulkLoad(new Path(stagingFolder), table.asInstanceOf[HTable])
//      load.doBulkLoad(new Path(stagingFolder) , connection.getAdmin , table , regionLocator)

      val endTime = System.currentTimeMillis()
      println(s"结束时间：-------->${endTime}")
      println(s"花费的时间：----------------->${(endTime - startTime)}ms")
    }catch{
      case e:IOException =>
        e.printStackTrace()
    }finally {
      if (table != null) {
        try {
          // 关闭HTable对象 table.close();
        } catch {
          case e: IOException =>
            e.printStackTrace();
        }
      }
      if (connection != null) {
        try { //关闭hbase连接.
          connection.close();
        } catch {
          case e: IOException =>
            e.printStackTrace();
        }
      }
    }
  }
}

落地部分

spark的bulkload报错及解决

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原文地址：https://www.cnblogs.com/niutao/p/10604165.html

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