标签：ons 计算方法 class cin 输入输出格式 整数 ott bin 题目
大家都知道，基因可以看作一个碱基对序列。它包含了44种核苷酸，简记作A,C,G,TA,C,G,T。生物学家正致力于寻找人类基因的功能，以利用于诊断疾病和发明药物。
在一个人类基因工作组的任务中，生物学家研究的是：两个基因的相似程度。因为这个研究对疾病的治疗有着非同寻常的作用。
两个基因的相似度的计算方法如下：
对于两个已知基因，例如AGTGATGAGTGATG和GTTAGGTTAG，将它们的碱基互相对应。当然，中间可以加入一些空碱基-，例如：
这样,两个基因之间的相似度就可以用碱基之间相似度的总和来描述，碱基之间的相似度如下表所示：
那么相似度就是：(-3)+5+5+(-2)+(-3)+5+(-3)+5=9(−3)+5+5+(−2)+(−3)+5+(−3)+5=9。因为两个基因的对应方法不唯一，例如又有：
相似度为：(-3)+5+5+(-2)+5+(-1)+5=14(−3)+5+5+(−2)+5+(−1)+5=14。规定两个基因的相似度为所有对应方法中，相似度最大的那个。
输入格式：
共两行。每行首先是一个整数，表示基因的长度；隔一个空格后是一个基因序列，序列中只含A,C,G,TA,C,G,T四个字母。1 \le1≤序列的长度\le 100≤100。
输出格式：
仅一行，即输入基因的相似度。
14
思路:dp[i][j]表示当前i和j匹配的最优情况 我们知道有三种情况 即i与j直接匹配 i和空格匹配 j和空格匹配 我们选取这三个的最大值
#include<cstdio> #include<cstring> #include<algorithm> #include<iostream> #include<string> #include<vector> #include<stack> #include<bitset> #include<cstdlib> #include<cmath> #include<set> #include<list> #include<deque> #include<map> #include<queue> #define ll long long int using namespace std; inline ll gcd(ll a,ll b){return b?gcd(b,a%b):a;} inline ll lcm(ll a,ll b){return a/gcd(a,b)*b;} int moth[13]={0,31,28,31,30,31,30,31,31,30,31,30,31}; int dir[2][2]={1,0 ,0,1}; int dirs[8][2]={1,0 ,0,1 ,-1,0 ,0,-1, -1,-1 ,-1,1 ,1,-1 ,1,1}; const int inf=0x3f3f3f3f; const ll mod=1e9+7; int c[5][5]={ {5,-1,-2,-1,-3}, {-1,5,-3,-2,-4}, {-2,-3,5,-2,-2}, {-1,-2,-2,5,-1}, {-3,-4,-2,-1,0} }; int dp[107][107]; //i和j匹配的最优解 int main(){ ios::sync_with_stdio(false); int n,m; string a,b; cin>>n>>a>>m>>b; map<char,int> mm; mm[‘A‘]=0; mm[‘C‘]=1; mm[‘G‘]=2; mm[‘T‘]=3; for(int i=1;i<=n;i++) for(int j=1;j<=m;j++) dp[i][j]=-inf; dp[0][0]=0; for(int i=1;i<=n;i++){ dp[i][0]=dp[i-1][0]+c[mm[a[i-1]]][4]; //初始化 } for(int i=1;i<=m;i++) dp[0][i]=dp[0][i-1]+c[4][mm[b[i-1]]]; //初始化 for(int i=1;i<=n;i++) for(int j=1;j<=m;j++){ dp[i][j]=max(dp[i][j],dp[i-1][j]+c[mm[a[i-1]]][4]); //i和空格匹配 dp[i][j]=max(dp[i][j],dp[i][j-1]+c[4][mm[b[j-1]]]); //j和空格匹配 dp[i][j]=max(dp[i][j],dp[i-1][j-1]+c[mm[a[i-1]]][mm[b[j-1]]]); //i和j匹配 } cout<<dp[n][m]<<endl; return 0; }
标签：ons 计算方法 class cin 输入输出格式 整数 ott bin 题目
原文地址：https://www.cnblogs.com/wmj6/p/10747922.html
