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gene ID,gene symbole,EnsembleID

时间:2019-10-15 09:44:23      阅读:221      评论:0      收藏:0      [点我收藏+]

标签:ota   tp5   developer   注释   功能   描述   online   分配   OLE   

gene symbol: TP53

gene ID:7157。Entrez Gene ID,它是目前国际上最权威的Gene ID编号

 

HGNC(人类基因命名委员会)只对人类基因进行命名。

HUGO Gene Symbol:HUGO Gene Symbol(也叫做HGNC Symbol,即基因符号)是HGNC组织对基因进行命名描述的一个缩写标识符(如:TP53),这些基因符号都是唯一的。

Gene Name:Gene Name是经过HGNC批准的全基因名称;对应于上面批准的符号(Gene Symbol)。例如TP53对应的Gene Name就是:tumor protein p53 。

HGNC ID:HGNC ID是HGNC数据库分配的基因编号,每一个标准的Symbol都有对应的HGNC ID 。我们可以用这个编号,在HGNC数据库中搜索相关的基因。例如:HGNC:11998 有时候HGNC会对一些已经命名过的基因进行重新审查和重新命名,以确保新的基因命名在描述基因功能方面更加的准确。当一个基因被HGNC分配了新的Gene Symbol时,它之前的命名,会被当作同义词继续使用,所以一般建议使用HGNC ID而不是HGNC Symbol来作为我们处理数据中的唯一标识符。

 

EnsembleID:

Ensembl:ENSG00000141510 即Ensembl数据库的ID编号,MIM:191170是来源于OMIM数据库(Online Mendelian Inheritance in Man ,人类孟德尔遗传在线数据库)的编号。Vega:OTTHUMG00000162125来自Vega数据库(Vertebrate Genome Annotation,脊椎动物基因组注释 )

 

NCBI的GenBank:

NCBI核酸序列数据库-GenBank

 

 

参考资料:https://cloud.tencent.com/developer/article/1358527

 

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标签:ota   tp5   developer   注释   功能   描述   online   分配   OLE   

原文地址:https://www.cnblogs.com/zypiner/p/11675327.html

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