在.slurm文件中激活Anaconda环境

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超算中心使用slurm作为集群调度。原始slurm脚本如下：

source activate tensorflow-gpu
python neural_style.py --content content/nju-1.jpg --styles style/18.jpg --output result-v100/result-nju-18.jpg

srun -p gpu -w g0051提交任务后报错：

很明显，第一句激活anaconda环境失败了，提示找不到conda activate可执行程序。

Google了一下，发现了这个：

https://github.com/conda/conda/issues/5071

看了一下，大概心里有数了，直接将slurm脚本改为：

source /home/xieweibo/project/software/anaconda3/bin/activate tensorflow-gpu
python neural_style.py --content content/nju-1.jpg --styles style/18.jpg --output result-v100/result-nju-18.jpg

也就是将conda activate可执行程序作为绝对路径在任务脚本中索引即可。

任务成功提交至调度系统：

tz@croplab, hzau

2019-11-23

在.slurm文件中激活Anaconda环境

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原文地址：https://www.cnblogs.com/acm-icpcer/p/11918058.html