参考基因组fasta文件添加index

标签：pre   命令   ica   creat   sequence   car   参考   部分   enc   

参考基因组fasta文件添加index

命令一

#faidx index
samtools faidx *.fa

命令二

# bwa index
bwa index -a bwtsw *.fa -p *.fa

命令三

#picard index
java -jar picard.jar CreateSequenceDictionary R=*.faO=*.dict

这三个命令下来，建立的参考基因组的index够大部分生信流程用

参考基因组fasta文件添加index

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原文地址：https://www.cnblogs.com/artesian0526/p/14512204.html