orthomcl 运行出错的解决办法

时间：2015-01-02 09:41:04 阅读：315 评论：0 收藏：0 [点我收藏+]

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blast结果5个G

similarSequences.txt 2.5G

运行失败，提示表的行数超过最大值，文件大小超过最大值。

需修改/etc/mysql/my.cnf

将myisam_sort_buffer_size = 8M修改为

myisam_sort_buffer_size = 64M

添加myisam_max_sort_file_size = 20G

将innodb_buffer_pool_size = 128M修改为

innodb_buffer_pool_size = 512M

将innodb_data_file_path = ibdata1:10M:autoextend:max:128M修改为

innodb_data_file_path = ibdata1:10M:autoextend:max:10G

最终运行成功

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原文地址：http://www.cnblogs.com/yumtaoist/p/4198139.html

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