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uva 1368 DNA Consensus String 字符串

时间:2015-01-31 14:20:42      阅读:117      评论:0      收藏:0      [点我收藏+]

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这学期离散数学的最后一章刚学了类似的东西

什么decoding function和humming distance手算起来才有点难 编程的话就很水了

 

#include <cstdio>
#include <cstring>
#include <cstdlib>
#include <iostream>
#include <algorithm>
#include <cmath>
#include <set>
#include <queue>
#include <stack>
#include <map>
#include <vector>

using namespace std;

typedef long long ll;
typedef unsigned long long ull;
typedef pair<int, int> P;

const int maxn = 20;

char a[55][1010];
char b[1010];

const char ch[] = {A, C, G, T};

int main()
{
    //freopen("in.txt", "r", stdin);
    //freopen("out.txt", "w", stdout);

    int T;
    scanf("%d", &T);


    while(T--)
    {
        int ans = 0;

        int m, n;
        scanf("%d%d", &m, &n);

        for(int i = 0; i < m; i++)
            scanf("%s", a[i]);

        int cnt[4];

        for(int i = 0; i < n; i++)
        {
            memset(cnt, 0, sizeof(cnt));

            for(int j = 0; j < m; j++)
            {
                int k = 0;
                while(ch[k] != a[j][i])
                    k++;
                cnt[k]++;
            }

            int maxnum = 0;
            for(int j = 0; j < 4; j++)
                if(cnt[j] > maxnum)
                    maxnum = cnt[j];

            for(int j = 0; j < 4; j++)
            {
                if(cnt[j] == maxnum)
                {
                    b[i] = ch[j];
                    ans += m - maxnum;
                    break;
                }
            }

        }
        b[n] = \0;

        printf("%s\n", b);
        printf("%d\n", ans);
    }

    return 0;
}

 

uva 1368 DNA Consensus String 字符串

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原文地址:http://www.cnblogs.com/dishu/p/4263889.html

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