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【编程题】(满分27分)
脱氧核糖核酸即常说的DNA,是一类带有遗传信息的生物大分子。它由4种主要的脱氧核苷酸(dAMP、dGMP、dCMT和dTMP)通过磷酸二酯键连接而成。这4种核苷酸可以分别记为:A、G、C、T。
DNA携带的遗传信息可以用形如:AGGTCGACTCCA.... 的串来表示。DNA在转录复制的过程中可能会发生随机的偏差,这才最终造就了生物的多样性。
为了简化问题,我们假设,DNA在复制的时候可能出现的偏差是(理论上,对每个碱基被复制时,都可能出现偏差):
1. 漏掉某个脱氧核苷酸。例如把 AGGT 复制成为:AGT
2. 错码,例如把 AGGT 复制成了:AGCT
3. 重码,例如把 AGGT 复制成了:AAGGT
如果某DNA串a,最少要经过 n 次出错,才能变为DNA串b,则称这两个DNA串的距离为 n。
例如:AGGTCATATTCC 与 CGGTCATATTC 的距离为 2
你的任务是:编写程序,找到两个DNA串的距离。
【输入、输出格式要求】
用户先输入整数n(n<100),表示接下来有2n行数据。
接下来输入的2n行每2行表示一组要比对的DNA。(每行数据长度<10000)
程序则输出n行,表示这n组DNA的距离。
例如:用户输入:
3
AGCTAAGGCCTT
AGCTAAGGCCT
AGCTAAGGCCTT
AGGCTAAGGCCTT
AGCTAAGGCCTT
AGCTTAAGGCTT
则程序应输出:
1
1
2
1 #include <iostream> 2 #include <cstdio> 3 #include <cstdlib> 4 #include <cstring> 5 #include <cmath> 6 #include <algorithm> 7 #include <string> 8 #include <vector> 9 #include <set> 10 #include <stack> 11 #include <queue> 12 #include <map> 13 #include <ctime> 14 #include <iomanip> 15 using namespace std; 16 const int INF=0x7ffffff; 17 const double EXP=1e-8; 18 const int MS=10005; 19 typedef long long LL; 20 int dp[MS][MS]; 21 22 int minv(int a,int b,int c) 23 { 24 return a>b?(b>c?c:b):(a>c?c:a); // min(a,min(b,c)) 25 } 26 /* 27 ACT 28 ACTT dp[i][j]=dp[i][j-1]+1; 29 30 31 ACTT 32 ACT dp[i][j]=dp[i-1][j]+1 丢失等效于增加 33 34 35 ACT 36 ACG dp[i][j]=d[i-1][j-1]+1 37 38 */ 39 40 41 42 43 void solve(string &s1,string &s2) 44 { 45 int len1=s1.length(); 46 int len2=s2.length(); 47 for(int i=0;i<=len1;i++) 48 dp[i][0]=i; 49 for(int i=0;i<=len2;i++) 50 dp[0][i]=i; 51 for(int i=1;i<=len1;i++) 52 { 53 for(int j=1;j<=len2;j++) 54 { 55 if(s1[i-1]==s2[j-1]) 56 dp[i][j]=dp[i-1][j-1]; 57 else 58 { // 增加 减少 修改 59 dp[i][j]=minv(dp[i][j-1]+1,dp[i-1][j]+1,dp[i-1][j-1]+1); 60 } 61 } 62 } 63 cout<<dp[len1][len2]<<endl; 64 return ; 65 } 66 67 int main() 68 { 69 int n; 70 string str1,str2; 71 cin>>n; 72 while(n--) 73 { 74 cin>>str1>>str2; 75 solve(str1,str2); 76 } 77 return 0; 78 }
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原文地址:http://www.cnblogs.com/767355675hutaishi/p/4295773.html