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All DNA is composed of a series of nucleotides abbreviated as A, C, G, and T, for example: "ACGAATTCCG". When studying DNA, it is sometimes useful to identify repeated sequences within the DNA.
Write a function to find all the 10-letter-long sequences (substrings) that occur more than once in a DNA molecule.
For example,
Given s = "AAAAACCCCCAAAAACCCCCCAAAAAGGGTTT", Return: ["AAAAACCCCC", "CCCCCAAAAA"].
思路：
开始用hash表存储所有出现过一次的字符串，结果空间超了。 有用最简单的循环，时间又超了。 做不出来，看答案。
大神的方法，思路是用一个整数来表示一个10字符长的字符串，相当于给字符串编码了。每个字母用一个 2位的二进制数表示 依次把每位对应的数字左移，后面或上新的表示数字。
//大神的方法 思路是用一个整数来表示一个10字符长的字符串 相当于给字符串编码了 vector<string> findRepeatedDnaSequences3(string s) { unordered_set<int> words; vector<string> ans; char* map = new char[26]; map[‘A‘ - ‘A‘] = 0; //A C G T 分别用二进制数 00 01 10 11表示 map[‘C‘ - ‘A‘] = 1; map[‘G‘ - ‘A‘] = 2; map[‘T‘ - ‘A‘] = 3; for(int i = 0; i + 9 < s.length(); i++) //遍历所有起始位置 { int v = 0; for(int j = i; j < i + 10; j++) { //对于一个字符串，每一个字母对应一个两位的二进制数 每次把数字左移两位 留出新的空位来放新字母对应的数 v <<= 2; v |= map[s[j] - ‘A‘]; } //如果数字已经出现过，并且还没有被放入答案中，压入答案 if(words.find(v) != words.end() && find(ans.begin(), ans.end(), s.substr(i, 10)) == ans.end()) { ans.push_back(s.substr(i, 10)); } else { words.insert(v); } } return ans; }
我的两个通不过的方法
//hash表 内存超了 vector<string> findRepeatedDnaSequences(string s) { vector<string> ans; unordered_set<string> hash; if(s.length() < 10) return ans; for(int i = 0; s.length() - i - 1 >= 10; i++) { string sub = s.substr(i, 10); if(find(ans.begin(), ans.end(), sub) != ans.end()) { continue; } if(hash.count(sub) == 0) { hash.insert(sub); } else { hash.erase(sub); ans.push_back(sub); } } return ans; } //简单的查找法 时间超了 vector<string> findRepeatedDnaSequences2(string s) { vector<string> ans; if(s.length() < 10) return ans; for(int i = 0; s.length() - i - 1 >= 10; i++) { string sub = s.substr(i, 10); if(find(ans.begin(), ans.end(), sub) != ans.end()) { continue; } else if(s.find(sub, i + 1) != s.npos) { ans.push_back(sub); } } return ans; } //大神的方法 思路是用一个整数来表示一个10字符长的字符串 相当于给字符串编码了 vector<string> findRepeatedDnaSequences3(string s) { unordered_set<int> words; vector<string> ans; char* map = new char[26]; map[‘A‘ - ‘A‘] = 0; //A C G T 分别用二进制数 00 01 10 11表示 map[‘C‘ - ‘A‘] = 1; map[‘G‘ - ‘A‘] = 2; map[‘T‘ - ‘A‘] = 3; for(int i = 0; i + 9 < s.length(); i++) //遍历所有起始位置 { int v = 0; for(int j = i; j < i + 10; j++) { //对于一个字符串，每一个字母对应一个两位的二进制数 每次把数字左移两位 留出新的空位来放新字母对应的数 v <<= 2; v |= map[s[j] - ‘A‘]; } //如果数字已经出现过，并且还没有被放入答案中，压入答案 if(words.find(v) != words.end() && find(ans.begin(), ans.end(), s.substr(i, 10)) == ans.end()) { ans.push_back(s.substr(i, 10)); } else { words.insert(v); } } return ans; }
【leetcode】Repeated DNA Sequences（middle）★
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原文地址：http://www.cnblogs.com/dplearning/p/4315197.html
